Journal of Mazandaran University of Medical Sciences

fa ژنوتایپینگ گونه های آسپرژیلوس فلاووس جدا شده از بیماران مبتلا به اتومایکوزیس در شهرستان بابل با استفاده از تکنیک مولکولی MLVA Genotyping of Aspergillus flavus Isolates from Patients with Otomycosis in Babol Using Multiple-Locus Variable Number Tandem-Repeat Analysis (MLVA) قارچ شناسي mycology گزارش کوتاه Brief Report سابقه و هدف: پس از آسپرژیلوس فومیگاتوس، آ. فلاووس دومین عامل اصلی آسپرژیلوزیس مهاجم و غیر تهاجمی است. اتومایکوزیس یک عفونت قارچی سطحی کانال گوش خارجی است که شیوع جهانی آن از 9 تا 30 درصد متغیر است. اتومایکوزیس معمولاً توسط گونه‌های آسپرژیلوس ایجاد می‌شود. مطالعه حاضر با هدف، ژنوتایپینگ سویه آسپرژیلوس فلاووس جدا شده از بیماران مبتلا به اتومایکوزیس در شهرستان بابل با استفاده از تکنیک مولکولی MLVA، انجام پذیرفت. مواد و روش ‌ها: مطالعه توصیفی - مقطعی حاضر، در طی دوره 5 ساله، نمونه‌های گوش توسط پزشک متخصص گوش، حلق و بینی توسط سواپ استریل برداشته شد. سپس انتقال نمونه در شرایط استریل به آزمایشگاه، برای آزمایش میکروسکوپی مستقیم با پتاس ۱۰ درصد و کشت بر محیط سابورو دکستروز آگار انجام شد. تعداد 40 ایزوله آسپرژیلوس فلاووس از بیماران مبتلا به اتومایکوزیس جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، تکینک تجزیه وتحلیل تعداد توالی های متغیر تکراری پشت سرهم چند لوکوس (MLVA) با 4 مارکر توالی‌های تکراری پشت سرهم (VNTR) برای آ. فلاووس (AFLA1، AFLA3، AFLA7 و AFMP3) به منظور تعیین تنوع ژنتیکی و ارتباط بالقوه بین سویه‌های بالینی با واکنش زنجیره ای پلیمراز انجام شد. یافته‌ها: میکروستلایت تایپینگ 40 ایزوله آسپرژیلوس فلاووس نشان دهنده 40 ژنوتایپ (سکانس تایپ) مختلف بوده است. شاخص تنوع سیمپسون هر یک از مارکر ها از 0/940-0/895 متغیر بود. هیچ یک از ایزوله‌ها قرابت ژنتیکی 100 را نشان ندادند. برترین مارکر با قدرت تمایز بالاتر در میان 40 ایزوله، مارکر AFLA1 بوده است. استنتاج: میکروستلایت ژنوتایپینگ نشان داد تنوع ژنتیکی بین ایزوله‌های آسپرژیلوس فلاووس جدا شده از اتومایکوزیس بسیار متنوع بوده است. هیچ شواهدی مبنی بر ارتباط ژنوتیپ خاص با تظاهرات بالینی آسپرژیلوس فلاووس اتومایکوزیس وجود نداشت. Background and purpose: After Aspergillus fumigatus, A. flavus is the second most common cause of invasive and non-invasive aspergillosis. Otomycosis is a superficial fungal infection of the external auditory canal, with a worldwide incidence ranging from 9% to 30%. Most cases of otomycosis are caused by Aspergillus species. The aim of the present study was to genotype A. flavus strains isolated from patients with otomycosis in Babol using the Multiple-Locus Variable Number Tandem-Repeat Analysis (MLVA) molecular technique. Materials and methods: In this descriptive cross-sectional study, ear samples were collected by an Ear, Nose and Throat (ENT) specialist using sterile swabs over a five-year period. The samples were then transferred to the mycology laboratory under sterile conditions for direct microscopic examination using 10% KOH and culture on Sabouraud dextrose agar. A total of 40 A. flavus isolates were collected from patients with otomycosis. After DNA extraction, MLVA was performed using four variable number tandem repeat (VNTR) markers for A. flavus (AFLA1, AFLA3, AFLA7, and AFMP3) to determine the genetic diversity and potential relatedness of the clinical isolates by polymerase chain reaction (PCR). Results: Microsatellite typing of the 40 A. flavus isolates identified 40 distinct genotypes (sequence types). The Simpson's index of diversity for the markers ranged from 0.895 to 0.940. No two isolates exhibited 100% genetic similarity. Among the four markers, AFLA1 demonstrated the highest discriminatory power. Conclusion: Microsatellite genotyping revealed considerable genetic diversity among A. flavus isolates obtained from patients with otomycosis. Furthermore, there was no evidence of an association between a specific genotype and the clinical presentation of A. flavus otomycosis. ژنوتایپینگ, آسپرژیلوس فلاووس, اتومایکوزیس Genotyping, Aspergillus flavus, Otomycosis 113 118 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-15858-2&slc_lang=fa&sid=1 Masoumeh Mohammadi معصومه محمدی foroogh.mohammadi97@gmail.com 1003194753284600187466 1003194753284600187466 No Medical Student, Student Research Committee, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran پزشکی عمومی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی بابل، بابل، ایران Saeid Mahdavi Omran سعید مهدوی عمران mahdavios@yahoo.co.uk 1003194753284600187467 1003194753284600187467 No Professor, Department of Medical Mycology, Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Health Research Institute, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran استاد، گروه قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی و گرمسیری، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی بابل، بابل، ایران Jalal Jafarzadeh جلال جعفرزاده j.jafarzade1@gmail.com 1003194753284600187468 1003194753284600187468 No PhD Student in Medical Mycology, Department of Medical Mycology, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran دانشجوی دکتری قارچ شناسی پزشکی، گروه قارچ شناسی پزشکی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران Keyvan Kiakojuri کیوان کیاکجوری kia_ko13358@yahoo.com 1003194753284600187469 1003194753284600187469 No Professor, Department of Ear, Nose, and Throat, Faculty of Medicine, Roohani Hospital, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran استاد، گروه گوش، حلق و بینی، دانشکده پزشکی، بیمارستان آیت الله روحانی، دانشگاه علوم پزشکی بابل، بابل، ایران Mojtaba Taghizadeh Armaki مجتبی تقی زاده ارمکی mojtabataghizade@yahoo.com 1003194753284600187470 1003194753284600187470 Yes Associate Professor, Department of Medical Mycology, Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Health Research Institute, Babol University of Medical Sciences, Babol, Iran دانشیار، گروه قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی و گرمسیری، پژوهشکده سلامت، دانشگاه علوم پزشکی بابل، بابل، ایران Ahmad Reza Aminian احمدرضا امینیان aminian.ahmadrezza@gmail.com 1003194753284600187471 1003194753284600187471 No PhD in Physiology, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Iran دکتری تخصصی فیزیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد، مشهد، ایران