fa نقد به مقاله " آنالیز منحنی ذوب DNA با کیفیت بالا (HRM) به منظور شناسایی استافیلوکوک اورئوس و سویه مقاوم به متی سیلین " ميکروبيولوژي Microbiology پژوهشي-کامل Research(Original) <div dir="RTL"><span style="font-family:b koodak;">سردبیر محترم</span></div> &nbsp; <div dir="RTL"><span style="font-family:b zar;">با آن که حوزه مقاومت به متی سیلین از اهمیت زیادی برخوردار بوده ولی مطالعات ناقص فراوانی در این خصوص گزارش شده است</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">(<a href="#_ENREF_1" title="Ataee, 2015 #13"><span style="text-decoration:none;text-underline:none;"><span style="color:windowtext;">1</span></span></a>)</span></span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span><span style="font-family:b zar;"> با آن که روش </span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-size:10.0pt;">high-resolution melting curve analysis</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;"> برای تشخیص</span></span><span style="font-family:b zar;"> بسیاری از ژن</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">های پروکاریوتی و یوکاریوتی گزارش شده است</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">(4-2)</span></span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span><span style="font-family:b zar;"> نویسندگان محترم به جای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">Resolution</span></span><span style="font-family:b zar;"> واژه </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">quality</span></span><span style="font-family:b zar;"> را به کار برده و به عنوان یک روش بسیار حساس برای تشخیص <em>استافیلوکوکوس آرئوس</em> مطرح کرده</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">اند، درحالی</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">که این روش برای تشخیص بسیاری از <span style="letter-spacing:-.2pt;">ژن</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">ها کاربرد دارد. بنابراین، لازم است به نکاتی اشاره شود:</span></span><br> <span style="font-family:b zar;">1- <em>عنوان مقاله :</em> در عنوان مقاله، آنالیز منحی ذوب </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b zar;"> با کیفیت بالا به منظور شناسایی <em>استافیلوکوکوس</em> </span><em><span style="font-family:b zar;">آرئوس</span></em> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="font-family:b zar;">ذکر شد. این روش برای شناسایی سایر باکتری</span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="font-family:b zar;">ها</span></span><span style="font-family:b zar;"> نیز کاربرد دارد و افزایش کیفیت ذوب به درجه خلوص و ترکیب بازهای </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b zar;"> استخراج شده بستگی دارد و نه چیز دیگر. هم</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">چنین، ابهام دیگری در عنوان وجود دارد زیرا، معلوم نیست باکتری مورد نظر به متی</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">سیلین مقاوم بوده و یا دو باکتری مجزا از هم هستند. از عنوان این گونه استنباط می</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">شود که مطالعه فوق از دو سویه </span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em><span style="font-family:b zar;">، یکی مقاوم به متی</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">سیلین و دیگری حساس بوده است.</span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">2- </span></span><em><span style="font-family:b zar;">مقدمه : </span></em><span style="font-family:b zar;">جستجو در پاپ مد نشان می</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">دهد طی 10 سال گذشته حدود 27 عنوان مقاله در خصوص متی</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">سیلین چاپ شده از ایران وجود دارد که به خوبی و به طور شایسته از آن</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">ها بهره</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">گیری نشده است.</span><span style="font-family:b zar;"> هم</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">چنین در مقدمه از ژن </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></em><span style="font-family:b zar;"> نام برده و به رفرنس شماره هفت ارجاع داده است که تناسب ندارد.</span><br> <span style="font-family:b zar;">از 60 تا سویه <em>استافیلوکوکوس</em> معرفی شده در سایت </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">in silico</span></span><span style="font-family:b zar;"> ؛ 9 سویه </span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="font-family:b zar;">فاقد ژن </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></em> <span style="font-family:b zar;">هستند (تصویر شماره 1) و مشخص نیست که آیا همه سویه هایی که این ژن را دارند به متی سیلین مقاوم باشند و یا درصد مقاومت آن ها یکسان باشد.</span><br> <span style="font-family:b zar;">3- <em>مواد و روش ها : </em></span><span style="font-family:b zar;">رقت</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">های ارایه شده<br> مناسب نمی باشند. زیرا، ذکر شده است که از<br> سوسپانسیون معادل استاندارد 5/0 مک فارلند<br> (</span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">CFU/ml</span></span><span style="font-family:b zar;"> 10⁸ &times; 5/1) <span style="letter-spacing:-.2pt;">رقت</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">های ذکر شده در زیر را</span></span> <span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;"><img alt="" border="0" height="28" src="file:///C:UsersMHAJIA~1AppDataLocalTempmsohtmlclip11clip_image002.jpg" width="46" ><img alt="" border="0" height="25" src="file:///C:UsersMHAJIA~1AppDataLocalTempmsohtmlclip11clip_image004.jpg" width="212" ></span></span>&nbsp;<span dir="LTR" style="position:relative;top:5.0pt;"><span style="font-size:10.0pt;"><img alt="" border="0" height="22" src="file:///C:UsersMHAJIA~1AppDataLocalTempmsohtmlclip11clip_image006.jpg" width="34" ></span></span>&nbsp;<span style="font-family:b zar;">تهیه نموده است که مناسب نیستند.</span></div> &nbsp; <div dir="RTL">&nbsp;<br> <span dir="LTR"><img alt="" border="0" height="313" src="file:///C:UsersMHAJIA~1AppDataLocalTempmsohtmlclip11clip_image008.jpg" width="572" ></span><br> &nbsp;<br> <strong><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:8.0pt;">تصویر شماره 1:</span></span></strong> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">واکنش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;"> مجازی با پرایمر های استفاده شده در&nbsp; مطالعه فوق توسط نرم افزار </span></span><span dir="LTR"><span style="font-size:8.0pt;">in-silico</span></span><br> &nbsp;</div> <br clear="all" > <span style="font-family:b zar;">اگر خواننده فرض نماید که این غلظت</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">ها نماینده تعداد سلول باکتری در هر میلی</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">لیتر باشد. سوسپانسیون ده به توان صفر (10⁰) یعنی یک عدد باکتری در هر <span style="letter-spacing:-.2pt;">میلی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">لیتر، حال اگر آن را 10 ، 100 ، 1000، و 10000 برابر</span></span><span style="font-family:b zar;"> رقیق نمایند چند عدد باکتری یا به عبارت دیگر چند </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">CFU</span></span><span style="font-family:b zar;"> در هر میلی لیتر بوده است ؟</span><br> <span style="font-family:b zar;">معلوم نیست رقت 10⁷ از استاندارد 5/0 مک فارلند تهیه شده یا از چیز دیگری؟ به همین ترتیب معلوم نیست رقت 10⁴ و^4-10 دارای چند عدد سلول باکتری بوده</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">اند؟ شایسته است محقق محترم ژن استخراج شده از هر رقت را اندازه</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">گیری و غلظت </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b zar;"> را برای هر رقت بیان کند تا بتواند به طور دقیق حساسیت کار را بیان نماید. </span><br> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="font-family:b zar;">مدل ارایه شده برای اختصاصیت صحیح نیست، مگر</span></span><span style="font-family:b zar;"> این</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">که برای آن رفرنس و دلیل علمی ذکر شده باشد. هر 12 رقت ذکر شده از یک ژن نشان</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">دهنده اختصاصیت نیست، اختصاصیت زمانی ایجاد می</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">شود که پرایمر مورد نظر به قطعات ژنی سایر باکتری</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">ها یا سایر ژن</span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="font-family:b zar;">ها به غیر از <em>استافیلوکوکوس</em> نچسبد.</span><br> <span style="font-family:b zar;">4- <em>یافته ها : </em>در نتایج حساسیت برای ژن </span><em><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></em><span style="font-family:b zar;"> ده هزار باکتری و برای ژن </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">mecA</span></span><span style="font-family:b zar;"> هزار سلول باکتری بیان شده است و در شکل نیز نشان داده شده است. در حالی که حساسیت روش تشخیص این ژن ها در حد 10 سلول باکتری گزارش شده است</span><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:9.0pt;">(<a href="#_ENREF_5" title="Ataee, 2012 #43"><span style="text-decoration:none;text-underline:none;"><span style="color:windowtext;">5</span></span></a>)</span></span><span style="font-family:b zar;">. بیان این اعداد قابل قبول نیست، ازطرفی محقق محترم می</span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="font-family:b zar;">توانست با اسکن نمودن غلظت باندها و یا تعیین غلظت </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span><span style="font-family:b zar;"> موجود در هر یک از رقت</span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="font-family:b zar;">ها و مقایسه با منابع موجود تعداد </span><span dir="LTR"><span style="font-size:10.0pt;">CFU</span></span><span style="font-family:b zar;"> را به طور دقیق محاسبه نماید.</span> <div dir="RTL"><span style="font-family:b titr;"><span style="font-size:16.0pt;">پاسخ به نقد مقاله </span></span><span style="font-family:cambria,serif;">&quot;</span> <span style="font-family:b elham;">آنالیز منحنی ذوب </span><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:18.0pt;">DNA</span></span></strong><span style="font-family:b elham;"> با کیفیت بالا (</span><strong><span dir="LTR"><span style="font-size:18.0pt;">HRM</span></span></strong><span style="font-family:b elham;">)<br> به منظور شناسایی <em>استافیلوکوک اورئوس</em> و<br> سویه مقاوم به متی سیلین</span> <span style="font-family:cambria,serif;">&quot;</span><br> &nbsp;<br> <span style="font-family:b koodak;"><span style="font-size:11.0pt;">محمد رضا عربستانی</span></span><br> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:8.0pt;">دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران</span></span><br> <span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:8.0pt;">مرکز تحقیقات بروسلوز، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران</span></span><br> &nbsp;<br> <span style="font-family:b koodak;">سردبیر محترم</span></div> <br clear="all" > <span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">ضمن تشکر از خواننده محترم و ارائه نظرات ارزشمند</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> ایشان، توجه خواننده عزیز را در خصوص موارد ذکر شده به نکات ذیل جلب می</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">نمایم:</span></span><br> <span style="font-family:b zar;">1- </span><em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">عنوان مقاله</span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> : البته که تکنیک </span></span><br> <span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">high-resolution melting curve analysis (HRM) </span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">، <span style="letter-spacing:-.2pt;">برای شناسایی بسیاری از ژن</span></span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">ها مورد استفاده قرار می</span></span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">گیرد</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">، ولی با توجه به این</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">که این مطالعه برای شناسایی و تشخیص باکتری </span></span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">و ژن مقاوم به متی سیلین در </span></span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">مورد استفاده قرار گرفته است، با این عنوان معرفی شده است.</span></span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">2- <em>مقدمه : </em>در خصوص عدم بهره</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">گیری از مقالات چاپ شده از ایران طی ده سال اخیر که منتقد<br> محترم به آن اشاره نموده</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">اند باید ذکر شود<br> که با توجه به این</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">که هدف شناسایی باکتری<br> استافیلوکوک و سویه مقاوم به متی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سیلین با روش </span></span><br> <span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">high-resolution melting curve analysis (HRM)</span></span></span><span style="color:white;"><span style="font-family:b zar;">،</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> بوده، نه اپیدمیولوژی سویه</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های مقاوم به متی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سیلین آن، بنابراین هم در مقدمه مقاله منابع شماره 11، 12، 14، 16 و هم در قسمت بحث مقاله، منابع شماره 22 الی 26 در زمینه تکنیک </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HRM</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> صحبت کرده</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">اند که به خوبی از آن</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">ها استفاده شده است<strong>. </strong>در رفرنس شماره 7 نواحی بین </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">16S-23 S rRNA</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> مورد بررسی قرار گرفته است که منظور همان نواحی </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> می</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">باشد.</span></span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">ناحیه </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> برای شناسایی جنس و گونه باکتری </span></span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">استفاده می</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">شود، نه برای شناسایی ژن مقاومت به متی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سیلین، که البته ممکن است بعضی از سویه</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های </span></span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">دارای ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">mec</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> نیز باشند و بعضی ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">mec</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> را نداشته باشند، بنابراین ممکن است ارتباطی بین ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span></em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">,</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> و مقاومت به متی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سیلین وجود نداشته باشد.</span></span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">3-<em> مواد و روش ها : </em></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">در ارتباط با رقت</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های به کار رفته در انجام مطالعه لازم است ذکر شود که، همان</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">طوری که در صفحه شماره 86 مقاله قسمت روش کار، بخش حساسیت و اختصاصیت پرایمرها اشاره شده است، تمامی رقت‌های تهیه شده بر مبنای 5/0 مک‌فارلند صورت گرفته است و حداقل مقدار آن </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">CFU/ml</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> 00015/0 یا همان ^4-10</span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;"> x</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> 5/1 در نظر گرفته شده است. لزوما تهیه رقت</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های کم</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">تر از 100 جهت تعیین میزان حساسیت بوده است که برخی دیگر از محققین از جمله </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">Ericksen</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> نیز از این رقت ها استفاده کرده</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">اند</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"><span style="font-size:10.0pt;">(1). </span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">همان</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">طوری که مستحضر هستید برای تهیه رقت بایستی </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">OD</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> یا جذب نوری </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> نیز اندازه</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">گیری شود که با دستگاه نانودراپ این کار انجام شده است.</span></span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">در خصوص مدل ارائه شده برای اختصاصیت در مطالعه حاضر باید اشاره شود که، جهت تعیین اختصاصیت پرایمر </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> و </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">mecA</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> در روش </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HRM</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">، دمای ذوب پرایمر مورد استفاده برای سویه‌های استاندارد </span></span><em><span style="font-family:b zar;">استافیلوکوکوس آرئوس</span></em> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">مقاوم به متی‌سیلین مورد ارزیابی قرار گرفت و با رسیدن به دمای86 و 81 درجه سانتی</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">گراد به ترتیب برای پرایمرهای </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> و </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">mecA</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">، اختصاصیت پرایمرها مشخص شد. البته، با استفاده از سایر باکتری‌ها در کنار سویه‌های استاندارد به عنوان کنترل منفی، پرایمرهای مورد نظر قادر به شناسایی سایر باکتری‌ها در این دما نبودند. در این جا صرفا به خاطر جلوگیری از پیچیدگی تصاویر، شکل</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">هایی اختصاصی برای این دو ژن یعنی </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">ITS</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> و ژن </span></span><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">mecA</span></span></span></em><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> آورده شده و از ذکر تصاویر دیگر خودداری شده است.</span></span><br> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">4- <em>یافته ها : </em>در تصویر شماره 1 که اعداد بالا ذکر شده، تصویرمربوط به ژل آگارز می</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">باشد که همان</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">گونه</span></span> <span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">که مستحضر هستید قدرت تفکیک ژل آگارز در مقایسه با روش </span></span><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">Real TimePCR</span></span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> بسیار پایین</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">تر می</span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">باشد که یک امر بدیهی است.</span></span><br> <br> &nbsp; Letter to editor <span dir="RTL">&quot;</span> <strong>Applying High-quality DNA Melting Curve Analysis</strong><strong> in Identifying <em>Staphylococcus aureus</em> and Methicillin-resistant Strains</strong> <span dir="RTL">&quot;</span><br> &nbsp;<br> Ramezan Ali Ataee<br> &nbsp;<br> Professor, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Applied Microbiology Research Center, System Biology, Poisoning Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran<br> Reply to Letter to editor <span dir="RTL">&quot;</span> <strong>Applying High-quality DNA Melting Curve Analysis in Identifying <em>Staphylococcus aureus</em> and </strong><br> <strong>Methicillin-resistant Strains </strong><span dir="RTL">&quot;</span><br> &nbsp;<br> Mohammad Reza Arabestani<br> &nbsp;<br> Associate Professor, Department of Microbiology, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran<br> Brucellosis Research Center, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran<br> &nbsp; نقد,نقد,نقد Letter to editor,Letter to editor,Letter to editor 176 180 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3719-7&slc_lang=fa&sid=1 Ramezan Ali Ataee رمضانعلی عطایی ataee216@gmai.com 1003194753284600106293 1003194753284600106293 Yes Professor, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Applied Microbiology Research Center, System Biology, Poisoning Institute, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran استاد، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، کمیته توسعه تحقیقات بالینی بیمارستان، مرکز تحقیقات میکروب شناسی کاربردی، سیستم بیولوژی، انستیتوی سم شناسی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران