en مطالعه‌ی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژن‌های UBE2Wو SSX2IP در سلول‌های‌ سرطانی HepG2 تیمار شده با ملاتونین ژنتیک genetic پژوهشي-کامل Research(Original) <strong>سابقه و اهداف</strong>: &nbsp;هدف از مطالعه حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تاثیر ملاتونین بر بیان ژن&shy;های <span dir="LTR">UBE2W</span>&nbsp; و <span dir="LTR">SSX2IP</span> در رده سلولی <span dir="LTR">HepG2</span> تیمار شده با داروی ملاتونین می&shy;باشد. <span dir="LTR">UBE2W</span> پروتئینی را رمزگذاری می کند که باعث افزایش یوبی&shy;کویتینه شدن پروتئین&shy;های گروه مکمل آنمی فانکونی شده و ممکن است در ترمیم آسیب <span dir="LTR">DNA</span> مهم باشد. <span dir="LTR">SSX2IP</span> متعلق به سیستم اتصال سلولی است که در حرکت سلول دخیل است و به عنوان یک عامل بلوغ سانتروزوم عمل می کند.<br> <strong>مواد و روش&shy;ها</strong>: در ابتدا، نرم افزار <span dir="LTR">MATLAB 2018a</span> برای ارزیابی میزان بیان ژن&shy;های&nbsp; <span dir="LTR">UBE2W</span>&nbsp; و <span dir="LTR">SSX2IP</span> از داده&shy;های میکرو آرایه مورد استفاده قرار گرفت. سپس، بعد از طراحی و تهیه پرایمرها، آزمایشات تجربی شامل تست <span dir="LTR">MTT</span> و <span dir="LTR">Real-time PCR</span> انجام گرفت.<br> <strong>یافته‌ها</strong>: نتیجه تست <span dir="LTR">MTT</span> نشان داد که زنده مانی سلول مورد مطالعه در گروه تیمار شده با ملاتونین بصورت معنی داری کاهش می یابد و میزان <span dir="LTR">IC50</span> برای 48 ساعت برابر 450 میکرومولار تخمین زده شد. نتایج <span dir="LTR">Real-time PCR </span>&nbsp;ثابت کرد که میزان بیان هر دو ژن مورد مطالعه در سلول&shy;های تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه شاهد افزایش ( غیر معنی&shy;دار <span dir="LTR">p&ge; 0.05</span> در 24 ساعت و معنی&shy;دار <span dir="LTR">p&le;0.05</span> در 48 ساعت) می یابد که هم&shy; راستا با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی می&shy;باشد.<br> <strong>استنتاج</strong>: نتایج این مطالعه نشان می&shy;دهد که <span dir="LTR">UBE2W</span>&nbsp; و&nbsp; <span dir="LTR">SSX2IP</span> می&shy;توانند به عنوان ژن هدف در درمان هپاتوسلولار کارسینوما به کار گرفته شود، اگر چه برای تایید این نتایج نیاز به انجام مطالعات گسترده می&shy;باشد.&nbsp; <strong>Background and purpose:</strong> The aim of this study was to bioinformatically and experimentally evaluate the effect of melatonin on the expression levels of <em>UBE2W</em> and <em>SSX2IP</em> genes in melatonin treated Human Hepatocellular carcinoma G2 (HepG2) cancer cell line. <em>UBE2W</em> encodes a protein that promotes ubiquitination of Fanconi anemia complementation group proteins and may be important in the repair of DNA damage. <em>SSX2IP</em> belongs to an adhesion system, involved in cell movement and acts as a centrosome maturation factor.<br> <strong>Materials and methods:</strong> At first, as a bioinformatics tool, MATLAB 2018a software was employed to evaluate the <em>UBE2W</em> and <em>SSX2IP</em> genes expression levels using microarray data. Then, after designing and preparing the primers, MTT and Real-time PCR were carried out in three replicates.<br> <strong>Results:</strong> MTT assay showed that the viability of cancer cell significantly decreased in melatonin treated group (P&le;0.01). The IC₅₀ value was estimated to be 2080 &micro;M for 48 hours, but no significant changes were seen in the survival of human normal cells (HUVEC-C) (P&ge;0.05). Real-time PCR proved that the expression levels of both genes increased (P&ge;0.05 in 24h and P&le; 0.05 in 48h) in melatonin treated cells compared to un-treated group, which was in accordance with bioinformatics analysis.<br> <strong>Conclusion:</strong> Our study showed that <em>UBE2W</em> and <em>SSX2IP</em> genes could be used as therapeutic target genes for Hepatocellular carcinoma. However, complementary studies are needed to prove current findings. ملاتونین, کارسینومای هپاتوسلولار, بیوانفورماتیک, داده‌های میکرو آرایه melatonin, Hepatocellular carcinoma, bioinformatics, microarray data 12 23 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-7617-3&slc_lang=en&sid=1 Ali Rajabi علی رجبی a.rajabi@tabrizu.ac.ir 0000-0002-5890-4462 No PhD Student in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran 1. دانشجوی دکترای ژنتیک، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران Ali Emami علی امامی ali.emami7095@ms.tabrizu.ac.ir 0000-0001-5863-8304 No MSc in Genetics, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran کارشناسی ارشد ژنتیک، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران Behnaz Barzegarzadeh Namarvar بهناز برزگرزاده نمرور b.barzegar.67@gmail.com 0000-0001-7385-9391 No MSc in Animal Physiology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran .. کارشناسی ارشد فیزیولوژی جانوری، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران Reza Safaralizadeh رضا صفرعلیزاده safaralizadeh@tabrizu.ac.ir 0000-0002-6970-6998 Yes Associate Professor, Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran دانشیار، گروه زیست شناسی جانوری، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران