Journal of Mazandaran University of Medical Sciences

en واکنش زنجیره ای پلیمراز- چند شکلی طول قطعه محدود (PCR-RFLP)؛ متد سریع و ساده در تشخیص قارچ‌های بیماری زا Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism, A Rapid and Simple Method for Identification of Pathogenic Fungi قارچ شناسي mycology مروری Review در سال‌های اخیر، بروز عفونت‌های ناشی از قارچ‌های بیماری‌زا در سطح جهانی افزایش یافته است، به‌ویژه در بیماران مبتلا به نقص ایمنی، بیماران پیوندی و یا بیمارانی که تحت شیمی‌درمانی در بخش‌های مراقبت‌های ویژه قرار می‌گیرند. با توجه به موربیدیتی و گسترش سریع عفونت به سایر اندام‌ها، تشخیص دقیق، سریع و درمان عفونت‌های قارچی امری ضروری است. روش‌های مولکولی از جمله polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism دارای برتری قابل توجهی در حساسیت و ویژگی نسبت به روش‌های مرسوم است. هدف از این مطالعه اشاره به محدودیت‌های روش‌های تشخیصی متداول و عوامل مؤثر بر حساسیت و ویژگی تست تشخیصی مولکولی PCR-RFLP است. در این مطالعه مروری، مطالب علمی مرتبط با موضوع، شامل جستجوی کلید واژه‌های قارچ‌های بیماری‌زا، روش‌های تشخیصی مولکولی RFLP، در بانک‌های اطلاعاتی فارسی و هم‌چنین جستجو در سایر بانک‌های الکترونیکی لاتین مشتمل بر Scopus، Web of science و PubMed تا سال 2023 جمع‌آوری و مورد مطالعه قرار گرفت. با بررسی مقالات متعدد دیده شد که روش RFLP-PCR سریع، عملی و قابل اعتماد است و می‌تواند در آزمایشگاه‌ها در تعیین گونه‌های قارچی جداشده از نمونه‌های بالینی استفاده شود. از جمله معایب PCR-RFLP، تعیین دقیق پلی‌مورفیسم‌های تک نوکلئوتیدی (SNPs) در یک مکان تشخیصی خاص است.   In recent years, the incidence of infections caused by pathogenic fungi has increased globally, especially in immunocompromised patients, transplant patients, or patients undergoing chemotherapy in intensive care units. Due to the morbidity and rapid spread of infection to other organs, accurate, rapid diagnosis and treatment of fungal infections is essential. Molecular methods such as polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) have significant superiority in sensitivity and specificity compared to conventional methods. The aim of this study is to point out the limitations of common diagnostic methods and factors affecting the sensitivity and specificity of PCR-RFLP molecular diagnostic test. This article is a review study for which subject-related academic papers (before 2023) were collected and studied by searching the keywords of pathogenic fungi, and RFLP molecular diagnostic methods; in Persian databases as well as Latin electronic databases including Scopus, Web of Science, and PubMed . Reviewing numerous articles showed that PCR-RFLP is a rapid, practical, and reliable method, which can be used in laboratories to determine the genotype of specific variants of fungal species isolated from clinical samples. However, there are several limitations for PCR-RFLP method demanding for more attention. The main limitations are the need for specific restriction enzymes and the difficulty of accurately determining single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a specific diagnostic locus.   قارچ‌های بیماری‌زا, روش‌های تشخیصی مولکولی, PCR-RFLP RFLP, molecular diagnostic technique, fungi 244 260 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3146-3&slc_lang=en&sid=1 Robab Ebrahimi Barogh رباب ابراهیمی باروق ROBABEBRAHIMIBAROGH@gmail.com 1003194753284600161737 1003194753284600161737 No PhD Student, Student Research Committee, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran دانشجوی دکترای قارچ شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، مازندران، ساری، ایران Iman Haghani ایمان حقانی imaan.haghaimaan.haghani@gmail.com 1003194753284600161738 1003194753284600161738 No Assistant Professor, Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran اﺳﺘﺎدیﺎر، ﻣﺮﮐﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻗﺎرچ ﻫﺎی ﺗﻬﺎﺟﻤﯽ، ﭘﮋوﻫﺸﮑﺪه ﺑﯿﻤﺎری ﻫﺎی واﮔﯿﺮ، داﻧﺸﮕﺎه ﻋﻠﻮم ﭘﺰﺷﮑﯽ ﻣﺎزﻧﺪران، ﺳﺎری، ایﺮان Javad Javidnia جواد جاویدنیا javidniaj@gmail.com 1003194753284600161739 1003194753284600161739 No PhD in Medical Mycology, Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran دﮐﺘﺮی ﺗﺨﺼﺼﯽ ﻗﺎرچ ﺷﻨﺎﺳﯽ ﭘﺰﺷﮑﯽ، ﻣﺮﮐﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻗﺎرچ ﻫﺎی ﺗﻬﺎﺟﻤﯽ، ﭘﮋوﻫﺸﮑﺪه ﺑﯿﻤﺎری ﻫﺎی واﮔﯿﺮ، داﻧﺸﮕﺎه ﻋﻠﻮم ﭘﺰﺷﮑﯽ ﻣﺎزﻧﺪران، ﺳﺎری، ایﺮان Mahdi Abastabar مهدی عباس تبار mabastabar@gmail.com 1003194753284600161740 1003194753284600161740 Yes Associate Professor, Department of Medical Mycology, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran and Invasive Fungi Research Center, Communicable Diseases Institute, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran داﻧﺸﯿﺎر، ﮔﺮوه ﻗﺎرچ ﺷﻨﺎﺳﯽ، داﻧﺸﮑﺪه ﭘﺰﺷﮑﯽ، داﻧﺸﮕﺎه ﻋﻠﻮم ﭘﺰﺷﮑﯽ ﻣﺎزﻧﺪران، ﺳﺎری، ایﺮان و ﻣﺮﮐﺰ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت ﻗﺎرچ‌ﻫﺎی ﺗﻬﺎﺟﻤﯽ، ﭘﮋوﻫﺸﮑﺪه ﺑﯿﻤﺎری ﻫﺎی واﮔﯿﺮ، داﻧﺸﮕﺎه ﻋﻠﻮم ﭘﺰﺷﮑﯽ ﻣﺎزﻧﺪران، ﺳﺎری، ایﺮان