Journal of Mazandaran University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران
J Mazandaran Univ Med Sci
Medical Sciences
http://jmums.mazums.ac.ir
1
admin
1735-9260
1735-9279
fa
jalali
1386
9
1
gregorian
2007
12
1
17
61
online
1
fulltext
fa
شناسایی مولکولی کاندیدا آلبیکنس های جدا شده از بیماران انکولوژی در چهار مرکز آموزشی - درمانی استان مازندران (85-84)
Molecular Identification of Candida Albicans Isolated From the Oncology Patients at Four University Hospitals in Mazandaran Province (2005-6)
پژوهشي-کامل
Research(Original)
<div style="text-align: justify direction: rtl">
<span style="font-weight: bold">سابقه و هدف :</span> تشخیص به موقع گونههای کاندیدایی، دربقای بیماران مبتلا به مهار سیستم ایمنی، بسیار کمککننده است. به لحاظ اینکه میتوان درمان ضد قارچی موثر را در شرایطی که هنوز میزان قارچ پایین است، آغاز نمود. هدف از این مطالعه، شناسایی کاندیدا آلبیکنسهای (Candida Albicans) جدا شده از بیماران بخش تومور شناسی (Oncology) با روشهای مولکولی بود.
<br><span style="font-weight: bold">مواد و روشها :</span> 62 کاندیدا آلبیکنس مجزا با آزمونهای فنوتیپی(رنگ کلونی روی محیط کروم آگار، تشکیل جرم تیوب و تولید کلامیدوسپور روی محیط کورن میل آگار دارای 1 درصد توئین 80) شناسایی شدند، DNA ژنومی آنها با استفاده از روش گلس بید/ فنل- کلروفرم جدا گردید. منطقه متغیر D1/D2 در ناحیه ژنی rDNA(26S) در همه نمونهها به روش PCR و با استفاده از بتونههای (Primers) NL1/NL4 ، به اندازه (bp) 620 تقویت شد. الکتروفورز محصولات روی ژل آگارز 5/1 درصد انجام شد. تعیین توالی برای 18 محصول انجام شد و نتایج با کمک نرمافزار BLAST در سایت NCBI ارزیابی شد. تطبیق توالیها با استفاده از برنامه CLUSTAL-W(version 1.83) صورت گرفت.
<br><span style="font-weight: bold">یافتهها :</span> کلیه محصولات در جست و جوی Blast به عنوان کاندیدا آلبیکنس شناسایی شدند. همه توالیهای بررسی شده بیش از 99 درصد با توالی مرجع خود در بانک ژنی شباهت داشتند. 4 نژاد (Strain) مختلف برای گونه آلبیکنس شناسایی گردید، شامل: نژاد AA 1622b(13 نمونه)، 24698(3 نمونه)، TA 62(1 نمونه)و 551 FC( 1 نمونه). به علاوه 131 مکان متغیر نوکلئوتیدی نیز شناسایی شد.
<br><span style="font-weight: bold">استنتاج :</span> کاندیدا آلبیکنس گونه غالب تعیین شده با روش های فنوتیپی (Phentotypic) بود. به علاوه، شناسایی کاندیدا آلبیکنسها با تعیین توالی ناحیه ژنی (26S) rDNA، 100 درصد با نتایج حاصل از روشهای فنوتیپی مطابق بود.
</div>
<span style="font-weight: bold">Background and Purpose:</span> Early detection of Candida species in body site could improve the survival of the immunosuppressed patients by allowing the initiation of specific treatment while the fungal biomass is still low. The aim of this study was the identification of Candida albicans isolated from the oncology patients by molecular methods.
<br>
<span style="font-weight: bold">Materials and Methods:</span> Sixty two of Candida albicans isolated identified by phenotypic methods (color of colony on CHROMagar medium, germ-tube formation in horse serum, chlamydospore formation on Cornmeal agar with 1% Tween 80). DNA was extracted by using a glass bead/phenol- chloroform method. The oligonucleotide primer pairs (NL1/NL4) were used to amplify a 620-bp fragment of D1/D2 region of large submit (26s) ribosomal DNA gene. PCR-products were electrophoresed in a 1.5% agarose gel. Eighteen PCR-amplified products sequenced and results were evaluated by online BLAST software. Multiple sequence alignment was performed by using online CLUSTAL-W (version 1.83) software.
<br>
<span style="font-weight: bold">Results:</span> The BLAST search revealed that all of products were Candida albicans. All sequences showed >99% similarity when compared with known reference sequences at the Gene-Bank. Four different strains were obtained of albicans species, including: AA 1622b (13 samples), 24698 (3 samples), TA 62 (1samples) and 551 FC (1 sample). A total of 131 nucleotide exchange sites were revealed.
<br><span style="font-weight: bold">Conclusion:</span> The dominant species by phenotypic approaches was Candida albicans. In addition, identification of Candida albicans by (26S) rDNA sequencing was 100% concordant to the results obtained by the phenotypic methods.
بتا تالاسمی ماژور، بتا تالاسمی اینتر مدیا، سنگ صفراوی، هیدروکسی اوره
Candida albicans, Oncology, Mazandaran Province, Molecular identification
1
11
http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-260&slc_lang=fa&sid=1
M
Fatahi
معصومه
فتاحی
10031947532846005718
10031947532846005718
Yes
T
Shokohi
طاهره
شکوهی
10031947532846005719
10031947532846005719
No
M.B
Hashemi Sooteh
سیدمحمدباقر
هاشمی سوته
10031947532846005720
10031947532846005720
No
M.T
Hedayati
محمدتقی
هدایتی
10031947532846005721
10031947532846005721
No
A
Okhovatian
علی
اخوتیان
10031947532846005722
10031947532846005722
No
A
Tamadoni
احمد
تمدنی
10031947532846005723
10031947532846005723
No
H
Karami
حسین
کرمی
10031947532846005724
10031947532846005724
No
D
Moslemi
داریوش
مسلمی
10031947532846005725
10031947532846005725
No
M
Ayaz
مسعود
ایاز
10031947532846005726
10031947532846005726
No