fa گروه بندی سویه های مختلف باکتری اشرشیا کلی با استفاده از تعیین PCR و مقایسه آن با روش مولتی پلکس thrB توالی ژن ميکروبيولوژي Microbiology پژوهشي-کامل Research(Original) سابقه و هدف: از مهم ترین گروه های شناخته شده باکتری می باشند. بررسی ها نشان داده این گروه ها دارای تفاوت هایی در بسیاری از ویژگی های خود از جمله میزان مقاومت به آنتی بیوتیک ها، نرخ رشد و میزان پاتوژنسیته می باشند که در نتیجه شناسایی گروه های مختلف آن می تواند در درمان بیماری هایی که توسط این باکتری ایجاد م ی شوند موثر باشد . در این بررسی سعی گردیده با توجه به وجود یک سری روشی دقیق جهت شناسایی گروه های مختلف ارائه گردد. ،E. coli اشکالات در روش های قبلی شناسایی گروه های و گروه بندی آن ها توسط روش E. coli مواد و روش ها: در این مطالعه بعد از بررسی توالی کامل 60 سویه باکتری مجازی ، توالی پلی مورف از ژن هوموسرین کیناز جهت گروه بندی PCR با نرم افزارهای PCR مرسوم مولتی پلکس انتخاب گردید و 20 نمونه سویه باکتری فوق توسط این روش و روش مولتی پلکس E. coli سویه های مختلف باکتری تعیین گروه شدند. PCR و روش تعیین توالی به PCR یافته ها: 20 نمونه مورد بررسی در این تحقیق توسط دو روش مرسوم مولتی پلکس صورت صحیح و مشابه گروه بندی گردیدند. ،PCR با روش تعیین توالی نسبت به روش مولتی پلکس E. coli استنتاج: تعیین گروه سویه های مختلف باکتری دقیق تر و مطمئن می باشد. Background and purpose: The best-known groups of Escherichia coli are B2, B1, A, and D. Previous studies have clearly shown the difference between this group such as resistance to antibiotics, the growth rate, and pathogenicity. Therefore, identifying different groups of E. coli could be of great benefit in curing infections caused by this bacterium. There are some defects in traditional diagnosis methods for E. coli groups, hence, this study aimed at finding a more efficient method. Material and methods: To identify different E. coli groups, after surveying genomic sequence of 60 E. coli and their grouping which was done by silico multiplex PCR method, a polymorphic sequence of homoserine kinase enzyme was selected. Then, 20 unknown samples of E. coli strains were grouped by this sequence and multiplex PCR methods. Results: The 20 unknown samples of E. coli strains were grouped identically in both methods. Conclusion: Identification and grouping of different E. coli strains by sequencing method was found to be more precise than multiplex PCR method. هوموسرین کیناز, تعیین توالی ,PCR گروه بندی, مولتی پلکس , Escherichia coli Escherichia coli, multiplex PCR, grouping, homoserine kinase, sequencing 101 112 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-3397-10&slc_lang=fa&sid=1 Fatemeh Azizi فاطمه عزیزی 100319475328460039349 100319475328460039349 No علوم پزشکی مازندران علوم پزشکی مازندران Soghra Fallahi صغری فلاحی fallahi.leila@gmail.com 100319475328460039350 100319475328460039350 Yes علوم پزشکی مازندران علوم پزشکی مازندران Majid Asadi-Samani مجید اسدی سامانی 100319475328460039351 100319475328460039351 No علوم پزشکی مازندران علوم پزشکی مازندران Maryam Goudarzian مریم گودرزیان 100319475328460039352 100319475328460039352 No علوم پزشکی مازندران علوم پزشکی مازندران