<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Mazandaran University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران</title_fa>
<short_title>J Mazandaran Univ Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-9260</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-9279</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1393</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2014</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>24</volume>
<number>116</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>جهت scaF بررسی بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی ژن جدید شناسایی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس</title_fa>
	<title>Bioinformatic and In-vitro Characterization of scaF as a Novel Gene for Identification of Staphylococcus aureus Isolates</title>
	<subject_fa> ميکروبيولوژي</subject_fa>
	<subject> Microbiology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي-کامل</content_type_fa>
	<content_type>Research(Original)</content_type>
	<abstract_fa>سابقه و هدف : با توجه به تنوع ژنومی گونه ها و سویه های استافیلوکوکوس، تشخیص سریع باکتری استافیلوکوکوس
اورئوس در نمونه های بالینی برای کاهش انتقال و گسترش این پاتوژن امری ضروری است. یکی از را ه های تشخیص سریع،
انتخاب یکی از ژن های آن جهت شناسایی است . هدف از این مطالعه، شناسایی ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس با
می باشد. scaF استفاده از ژن
مواد و روش ها : این مطالعه در سال 1392 روی 45 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از نمونه های بالینی
با کمک نرم افزارهای وب مورد بررسی قرار scaF بیمارستان های دانشگاه علوم پزشکی تهران انجام گرفت . ابتدا ژن
گرفت. در ادامه با کمک روش های بیوشیمیایی و آزمون های تشخیصی، ایزوله های استافیلوکوکوس اورئوس مورد تائید
با واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای اختصاصی در این ایزول ه ها scaF ژنومی، ژن DNA قرار گرفتند . متعاقب استخراج
توسط روش ژل الکتروفورز مورد بررسی قرار گرفتند. polymerase chainreaction(PCR) تکثیر یافت. نتایج حاصل از
مثبت گردید . بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که این ژن، ،scaF یافته ها : در همه ایزوله های مورد مطالعه وجود ژن
6می باشد . / پروتئینی به وزن مولکولی 33 کیلودالتون را کد کرده که دارای 297 اسیدآمینه است و نقطه ایزوالکتریک آن 3
تاکنون این پروتئین مورد بررسی آزمایشگاهی قرار نگرفته است.
بوده که در سویه های Staphylococcal conserved antigens متعلق به خانواده ژنی scaF استنتاج: ژن
حفاظت شده می باشد. علاوه بر این، به علت عدم وجود ژن ،JCVI استافیلوکوکوس اورئوس ثبت شده در پایگاه اطلاعاتی
مشابه در استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس و سایر گونه ها می توان از آن برای تشخیص استافیلوکوکوس اورئوس در عفون تها
استفاده کرد.</abstract_fa>
	<abstract>Background and purpose: Rapid detection of Staphylococcus aureus in clinical specimens is
essential to minimize the transfer and spread of this pathogen. An appropriate method for rapid and
suitable detection of S. aureus is detection of one of its genes. The aim of this study was to identify the S.
aureus using scaF gene.
Material and Methods: The study was conducted on 45 isolates of S. aureus separated from
clinical specimens of patients who referred to hospitals affiliated with Tehran University of Medical
Sciences in 2013. At first, scaF gene was analyzed by bioinformatic tools. S.aureus isolates were
confirmed using biochemical and diagnostic tests. Following DNA extraction, scaF gene was amplified
by polymerase chain reaction using gene-specific primers. The results of PCR were examined by gel
electrophoresis.
Results: The scaF gene was present in all studied isolates. Bioinformatics evaluation revealed
that this gene encodes a protein with a molecular weight of 33kDa and contains 297amino acids with a PI
value of 6.3.
Conclusion: The scaF gene belongs to Staphylococcal conserved antigen family which is
conserved in S. aureus strains recorded in JCVI database. Furthermore, due to lack of the same gene in
Staphylococcus epidermidis and other species, it could be used for detection of S. aureus infections.</abstract>
	<keyword_fa>scaF ,(PCR), استافیلوکوکوس اورئوس, واکنش زنجیره ای پلیمراز</keyword_fa>
	<keyword>Staphylococcus aureus, polymerase chain reaction, detection, scaF</keyword>
	<start_page>52</start_page>
	<end_page>57</end_page>
	<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-3397-19&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Mohammad Reza</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Pourmand</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>پورمند</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mpourmand@tums.ac.ir</email>
	<code>100319475328460039023</code>
	<orcid>100319475328460039023</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation> Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه پاتوبیولوژی ، دانشکده بهداشت ، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Elaheh</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Salami</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>الهه</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سلیمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460039024</code>
	<orcid>100319475328460039024</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه پاتوبیولوژی ، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Jalil</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Fallah Mehrabadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جلیل</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فلاح مهرآبادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460039025</code>
	<orcid>100319475328460039025</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Bioscience and Biotechnology, Malekashtar University of Technology, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>پژوهشکده علوم وفناوری زیستی، دانشگاه صنعتی مالک اشتر</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Azar</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Hadadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>آذر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حدادی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460039026</code>
	<orcid>100319475328460039026</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Department of Infectious Diseases, Sina Hospital, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>بیمارستان سینا، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Rahil</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mashhadi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>راحیل</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مشهدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460039027</code>
	<orcid>100319475328460039027</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Urology Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>مرکز تحقیقات ارولوژی ، دانشگاه علوم پزشکی تهران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
