fa شناسایی سریع پاتوژن‌های قارچی در نمونه‌های کشت خون بیماران سوختگی شدید با روش Panfungal PCR ميکروبيولوژي Microbiology پژوهشي-کامل Research(Original) <p dir="RTL">سابقه و هدف: عفونت قارچی خون یکی از علل مرگ و میر بیماران دچار ضعف ایمنی از جمله بیماران دچار سوختگی وسیع محسوب می‌شود. از آن‌جا که روش‌های کشت خون و شناسایی عوامل قارچی عفونت‌های خون حساسیت پایینی داشته و به زمان زیادی نیز احتیاج دارند، این تحقیق با هدف شناسایی پاتوژن‌های قارچی در نمونه‌های کشت بیماران سوختگی شدید مشکوک به بیماری‌های قارچی تهاجمی با روش <span dir="LTR">Panfungal PCR</span> طراحی گردید.</p> <p dir="RTL">مواد و روش‌ها: تعداد 400 نمونه کشت خون مربوط به 112 بیمار سوختگی شدید مشکوک به بیماری قارچی تهاجمی وارد مطالعه شد. پس از استخراج <span dir="LTR">DNA</span> ناحیه ژنی <span dir="LTR">18SrRNA</span> با واکنش‌های زنجیره‌ای پلیمراز تکثیر گردید. محصول <span dir="LTR">PCR</span> با استفاده از برنامه مرکز اطلاعات بین‌المللی بیو تکنولوژی تعیین توالی و شناسایی شدند.</p> <p dir="RTL">یافته‌ها: تعداد 44 (2/39 درصد) نمونه کشت خون 112بیمار مثبت گردید. ) میانگین سنی بیماران <span dir="LTR">PCR</span> مثبت<br> 7/14&plusmn; 9/31 سال و طول مدت بستری 3/10&plusmn; 8/21 روز وکل سوختگی 19&plusmn; 6/42 درصد بود. محصول <span dir="LTR">PCR</span> 20 بیمار <span dir="LTR">PCR</span> مثبت، به‌طور تصادفی تعیین توالی گردید و گونه‌های آسپرژیلوس فومیگاتوس (11 مورد؛ 55 درصد)، کاندیدا تروپیکالیس (5 مورد؛ 25 درصد)، کاندیدا آلبیکنس (1 مورد؛ 5 درصد)، کاندیدا پاراپسیلوزیس (1 مورد؛ 5 درصد)، آگاریکومایکوتینا (1 مورد؛ 5 درصد) و پنیسیلیوم (1 مورد؛ 5 درصد) شناسایی شدند. در سه بیمار گونه‌های شناسایی شده از کشت خون مثبت با روش روتین وروش مولکولی تطابق داشتند.</p> <p dir="RTL">استنتاج: روش مولکولی <span dir="LTR">Panfungal PCR</span> در تشخیص سریع قارچ‌های پاتوژن در کشت خون بیماران در معرض خطر بیماری‌های قارچی تهاجمی سودمند و نویدبخش است.</p> <p dir="RTL"></p> <p><strong>Background and purpose:</strong> Fungemia is a significant cause of morbidity and mortality among immunocompromised patients such as severe burns. Due to low sensitivity and long turnaround time of the traditional biphasic BHI blood culture to detect fungemia we aimed to detect fungal elements in blood culture of these patients suspected with invasive fungal disease (IFDs) using panfungal PCR assay.</p> <p><strong>Materials and methods:</strong> Four hundred blood cultures were obtained from 112 severely burned patients suspected with IFDs. DNA was extracted and a pair of fungal universal primers was used to amplify the 18SrRNA gene. The PCR product was sequenced and identified using the nucleotide Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)<strong>. </strong></p> <p><strong>Results:</strong> 44(39.2%) Blood culture of 112 patients (mean age: 31.9&plusmn;14.7 years) were positive. In PCR positive patients, mean burn size was 42.6&plusmn;19 % of total body surface area and average hospital length of stay was 21.8 &plusmn;10.3 days. In three patients, same species of fungi were determined in both sequencing of PCR products and the classical procedures of blood culture. Randomly sequencing of 20 PCR products revealed <em>Aspergillus</em> <em>fumigatus</em> (n=11 55%), <em>Candida tropicalis</em> (n=5 25%), <em>C. albicans</em> (n=1 5%), <em>C. parapsilosis</em> (n=1 5%), <em>Agaricomycotina</em> (n=1 5%), and <em>Penicillium</em> (n=1 5%) as causative agents.</p> <p><strong>Conclusion:</strong> Panfungal PCR assay on blood culture seems to be a promising method for rapid detection of fungi in blood culture of patients at risk for IFDs.</p> <p></p> بیماری قارچی تهاجمی, سوختگی, فونجمی, کاندیدا, آسپرژیلوس invasive fungal disease, burn, fungemia, Candida, Aspergillus 219 228 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-29-385&slc_lang=fa&sid=1 Akram Abdollahi اکرم عبداللهی 100319475328460086140 100319475328460086140 No MSc Student in Medical Mycology, Student Research Committee, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد قارچ شناسی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران Tahereh Shokohi طاهره شکوهی Shokohi.tahereh@gmail.com 100319475328460086141 100319475328460086141 Yes Professor, Department of Medical Mycology and Parasitology, Invasive Fungal Research Center, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran استاد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات قارچ های تهاجمی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران Mohamad Taghi Hedayati محمد تقی هدایتی 100319475328460086142 100319475328460086142 No Professor, Department of Medical Mycology and Parasitology, Invasive Fungal Research Center, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran استاد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات قارچ های تهاجمی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران Mojtaba Nabili مجتبی نبیلی 100319475328460086143 100319475328460086143 No PhD Student in Medical Mycology, Student Research Committee, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran4Iranian Social Security Organization, Mazandaran, Iran . دانشجوی دکتری قارچ شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران 4. سازمان تامین اجتماعی، مازندران، ایران Nazanin Lotfi نازنین لطفی 100319475328460086144 100319475328460086144 No MSc in Microbiology, Invasive Fungal Research Center, Faculty of Medicine, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran کارشناس ارشد میکروبیولوژی، مرکز تحقیقات قارچ های تهاجمی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران