fa تعیین ساختار ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به روش MIRU- VNTR 15 loci ميکروبيولوژي Microbiology پژوهشي-کامل Research(Original) <p dir="RTL" style="text-align:justify;text-justify:kashida;text-kashida:0%;text-indent:17.0pt;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">سابقه</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;"> و هدف:</span></span></span> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">سل یکی از علل اصلی مرگ و میر ناشی از بیماری</span></span></span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های عفونی در جهان است. در ایران، بر اساس آمار سازمان بهداشت جهانی</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;"> (WHO)</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">، میزان بروز سل 21 نفر در هر یکصد هزار نفر در سال 2015 گزارش شده است. مطالعه حاضر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی و نحوی انتقال <em>مایکوباکتریوم توبرکلوزیس</em> در شهر تهران، طراحی گردید.</span></span></span></p> <p dir="RTL" style="text-align:justify;text-justify:kashida;text-kashida:0%;text-indent:17.0pt;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">مواد و روش</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">ها:</span></span></span> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">تعداد 80 ایزوله <em>مایکوباکتریوم</em> <em>توبرکلوزیس</em> از بیماران مبتلا به سل مراجعه کننده به یکی بیمارستان</span></span></span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های آموزشی شهر تهران، از بهمن 1393 تا دی 1395 جدا شد. از روش استاندارد</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp; MIRU-VNTR </span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">برای ژنوتایپینگ ایزوله</span></span></span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های جدا شده استفاده شد</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span></span></p> <p dir="RTL" style="text-align:justify;text-justify:kashida;text-kashida:0%;text-indent:17.0pt;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">یافته</span></span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">‌</span></span></span><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">ها:</span></span></span> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">تعداد 78 پروفایل مختلف</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;"> VNTR </span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">شامل 2 کلاستر و 76 الگوی منحصر به فرد به</span></span></span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">دست آمد. میزان شاخص </span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">HGDI</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> برابر با 990/0 و نشان دهنده قدرت بالای افتراق روش </span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;">MIRU-VNTR</span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;"> بود. لوکوس</span></span></span><span style="font-family:b zar;">‌</span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">های</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;"> QUB26 </span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">&nbsp;و</span></span></span><span dir="LTR" style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-size:10.0pt;"> MTUB21 </span></span></span><span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">به عنوان لوکوس های با قدرت افتراق بالا شناخته شدند.</span></span></span></p> <p dir="RTL" style="text-align:justify;text-justify:kashida;text-kashida:0%;text-indent:17.0pt;direction:rtl;unicode-bidi:embed;"><span style="letter-spacing:-.2pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b koodak;">استنتاج:</span></span></span> <span style="letter-spacing:-.1pt;"><span style="color:black;"><span style="font-family:b zar;">تنوع ژنتیکی بالا در میان ایزوله های <em>مایکوباکتریوم</em> <em>توبرکلوزیس</em> بیانگر آن است که انتقال این ایزوله ها ممکن است از منابع مختلف رخ داده باشد.</span></span></span></p> <p><strong>Background and purpose:</strong> Tuberculosis is among the leading causes of death from infectious diseases in the world. According to World Health Organization (WHO), the estimated rate of TB in Iran was 21 per 100,000 populations in 2015. The present study was designed to evaluate the genetic diversity and transmission dynamics of <em>Mycobacterium tuberculosis</em> in Tehran, Iran.</p> <p><strong>Materials and methods:</strong> A total of 80 isolates of <em>Mycobacterium tuberculosis</em> was cultured from TB patients attending a teaching hospital in Tehran, Iran from January 2015 to December 2016. Standard 15-locus Mycobacterial Interspersed Repeat Units/Variable Numbers of Tandem Repeat (MIRU-VNTR) typing was applied to genotype clinical isolates.</p> <p><strong>Results:</strong> There were 78 different VNTR profiles comprising 2 clusters and 76 unique patterns. The Hunter &ndash; Gaston discriminatory index (HGDI) was 0.990, indicating a high power of discrimination for MIRU-VNTR typing. The QUB26 and MTUB21 loci were designated as highly discriminative.</p> <p><strong>Conclusion:</strong> The high genetic diversity among <em>Mycobacterium tuberculosis</em> isolates suggests that transmission may have been caused by different sources.</p> مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, ژنوتایپینگ, MIRU-VNTR, تهران, ایران Mycobacterium tuberculosis, genotyping, MIRU-VNTR, Tehran, Iran 40 48 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-7670-1&slc_lang=fa&sid=1 Taher Azimi طاهر عظیمی 100319475328460083630 100319475328460083630 No دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Aref Shariati عارف شریعتی 100319475328460083631 100319475328460083631 No دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Fatemeh Fallah فاطمه فلاح 100319475328460083632 100319475328460083632 No استاد، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Abbas Ali Imani Fooladi عباسعلی ایمانی فولادی 100319475328460083633 100319475328460083633 No استاد، مرکز تحقیقات میکروب شناسی کاربردی، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله، تهران، ایران Ali Hashemi علی هاشمی 100319475328460083634 100319475328460083634 No استادیار گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Hossein Goudarzi حسین گودرزی 100319475328460083635 100319475328460083635 No استاد، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Mohammad Javad Nasiri محمد جواد نصیری mj.nasiri@hotmail.com 100319475328460083636 100319475328460083636 Yes استادیار، مرکز تحقیقات بیماریهای عفونی و گرمسیری، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران