<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Mazandaran University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران</title_fa>
<short_title>J Mazandaran Univ Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-9260</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-9279</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1397</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>6</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>28</volume>
<number>161</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تشخیص استرپتوکوکوس پنومونیه بر اساس 
ژن‌های cpsB ، cpsD و psaA
</title_fa>
	<title>Diagnosis of Streptococcus Pneumoniae based on 
cpsB, cpsD, and psaA Genes


</title>
	<subject_fa>عفوني</subject_fa>
	<subject>infection</subject>
	<content_type_fa>گزارش کوتاه</content_type_fa>
	<content_type>Brief Report</content_type>
	<abstract_fa>&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;سابقه&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt; و هدف:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;تشخیص سریع عفونت&#8204;های پنوموککی به منظور درمان موفق و پیشگیری از عواقب آن بسیار مهم &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;letter-spacing:-.1pt;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;است. لذا، هدف ز این مطالعه راه اندازی روش &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;letter-spacing:-.1pt;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;letter-spacing:-.1pt;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; براساس ژن&#8204;های رمزکننده کپسول استرپتوکوکوس پنومونیه بوده است.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;مواد و روش&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;در این مطالعه تجربی، براساس سکانس رفرانس ژن&#8204;های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;cps&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;B&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;cps&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;D&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;aro&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;E&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;psa&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/em&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;A&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; استرپتوکوکوس پنومونیه پرایمرهای اختصاصی طراحی گردید. هر باکتری به طور جداگانه مورد استخراج ژن قرار گرفت. پروتکل &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; طراحی و انجام شد. محصول &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;PCR&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; سکانس و نتایج به صورت توصیفی تحلیل &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:#0D0D0D;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;گردید.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;یافته&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;ها:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;نتایج نشان داد، پرایمرهای طراحی شده علیه ژن های &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;cpsB&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;cpsD&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;aroE&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; و &lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:10.0pt;&quot;&gt;psaA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt; قادر به تکثیر قطعات 159، 202، 254 و 286 جفت بازی هستند. مقایسه و همسان سازی قطعات تکثیر شده با ژن&#8204;های رفرانس همولوژی 100 درصدی را نشان داد.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&lt;span dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;font-variant:small-caps;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b koodak;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;استنتاج:&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; &lt;span dir=&quot;RTL&quot; style=&quot;font-variant:normal !important;font-weight:normal;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:b zar;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:12.0pt;&quot;&gt;نتایج حاکی از آن بود که می&#8204;توان با استفاده از ژن&#8204;های ویرولانس سویه های استرپتوکوکوس پنومونیه بیماری زا را از سویه&#8204;های غیر بیماری زا و نیز سویه های ویریدانس تشخیص داد. بنابراین، با استفاده از روش ارایه شده در این تحقیق احتمالاً بتوان سویه های بیماری زای استرپتوکوکوس پنومونیه را تشخیص داد و گزارش نمود.&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;strong&gt;Background and purpose:&lt;/strong&gt; Fast diagnosis of pneumococcal infections is of great importance in achieving successful outcomes. The aim of this study was to use PCR process based on capsular encoding genes of &lt;em&gt;Streptococcus pneumonia.&lt;/em&gt;&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Materials and methods:&lt;/strong&gt; In this experimental study, specific primers were designed based on the reference sequences of the &lt;em&gt;Streptococcus pneumoniae&lt;/em&gt; &lt;em&gt;cps&lt;/em&gt;B, &lt;em&gt;cps&lt;/em&gt;D, &lt;em&gt;aro&lt;/em&gt;E, and &lt;em&gt;psa&lt;/em&gt;A genes. All bacteria were subjected to DNA extraction separately. Then, the PCR protocol was performed. Sequencing of the PCR products was done and data was analyzed descriptively.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; The primer pairs against the &lt;em&gt;cps&lt;/em&gt;B, &lt;em&gt;cps&lt;/em&gt;D, &lt;em&gt;aro&lt;/em&gt;E, and &lt;em&gt;psa&lt;/em&gt;A genes amplified 159, 202, 254, and 286 bp fragments, respectively. The alignments and comparison of amplified sequences showed a high homology (100%) with the reference genes.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; According to this study, it is possible to diagnose &lt;em&gt;Streptococcus pneumoniae&lt;/em&gt; based on virulence genes, and differentiate the pathogenic &lt;em&gt;Streptococcus pneumoniae&lt;/em&gt; from nonpathogenic strains and also viridans groups. Therefore, this method is suggested in diagnosis of pathogenic &lt;em&gt;Streptococcus pneumoniae&lt;/em&gt; strains.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;</abstract>
	<keyword_fa>زنجیره واکنش پلی‌مراز, استرپتوکوکوس پنومونیه, ژن‌های سازنده کپسول</keyword_fa>
	<keyword>PCR, Streptococcus pneumoniae, capsular genes</keyword>
	<start_page>121</start_page>
	<end_page>126</end_page>
	<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3719-4&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Asgari</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عسکری</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460092077</code>
	<orcid>100319475328460092077</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>MSc in Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>کارشناس ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، کمیته توسعه تحقیقات بیمارستان، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ramezan Ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ataee</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>رمضانعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عطایی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>ataee216@gmail.com</email>
	<code>100319475328460092078</code>
	<orcid>100319475328460092078</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Professor, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استاد، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، کمیته توسعه تحقیقات بیمارستان، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mahdi </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghorbanalizadegan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مهدی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قربانعلی زادگان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460092079</code>
	<orcid>100319475328460092079</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Assistant Professor, Department of Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استادیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، کمیته توسعه تحقیقات بیمارستان، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Ali </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Mehrabi Tavana</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>علی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مهرابی توانا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460092080</code>
	<orcid>100319475328460092080</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>MSc in Medical Microbiology, Faculty of Medicine, Hospital Research Development Committee, Baqiyatallah University of Medical Sciences, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>استاد، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، کمیته توسعه تحقیقات بیمارستان، دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
