<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Mazandaran University of Medical Sciences</title>
<title_fa>مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران</title_fa>
<short_title>J Mazandaran Univ Med Sci</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>1735-9260</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>1735-9279</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1387</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2009</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>19</volume>
<number>69</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>مقایسه دو روش تشخیصی کشت و آزمون تکثیری 16srDNA در شناسایی باکتری های مایع مغزی نخاعی بیماران مشکوک به مننژیت باکتریایی در قزوین</title_fa>
	<title>Comparison of 16S rDNA-PCR amplification and culture of cerebrospinal fluid for diagnosis of bacterial meningitisof bacterial meningitis</title>
	<subject_fa></subject_fa>
	<subject></subject>
	<content_type_fa>پژوهشي-کامل</content_type_fa>
	<content_type>Research(Original)</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify direction: rtl&quot;&gt;
&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;سابقه و هدف:&lt;/span&gt; تشخیص اولیه و صحیح مننژیت باکتریال از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است ولی به طور متداول امکانات آزمایشگاهی بهینه و سریعی در تشخیص عوامل مولد مننژیت وجود ندارد. هدف این ارزیابی مقایسه آزمون PCR با روش کشت در شناسایی باکتری مایع مغزی نخاعی (CSF) بیماران مشکوک به مننژیت در مراکز درمانی قزوین بود.&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;مواد و روش ها:&lt;/span&gt; 100 نمونهCSF جمع آوری شد و هر یک به دو قسمت تقسیم گردید. روی یک قسمت از آنها روش های رایج کشت و رنگ آمیزی لام اجرا شد و از بخش دیگر،DNA استخراج و با استفاده از پرایمرهای یونیورسال برای ژن16S rDNA روش PCR اجرا شد و خصوصیات کارایی این دو روش مورد ارزیابی قرار گرفت.&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;یافته ها:&lt;/span&gt; روش PCR توانست وجود ژنوم باکتریایی را در تمام 36 نمونه کشت مثبت و همچنین در 38 نمونه از 64 نمونه کشت منفی نشان دهد لذا دارای حساسیت 100 درصد، ویژگی 40.6 درصد، ارزش پیشگویی مثبت 48.6 درصد و ارزش پیشگویی منفی 100 درصد (در صورت پذیرفتن روش های باکتریولوژیک به عنوان آزمون طلایی) می باشد. اما ضریب کاپا، توافق بین دو روش را برابر 0.33 نشان داد.&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;استنتاج:&lt;/span&gt; خصوصیات کارایی هر دو روش PCR و کشت دارای مزایا و معایبی می باشد. لذا در فرایندهای بالینی استفاده از هر دو روش پیشنهاد می شود. به ویژه در مواردی که شک به آلودگی نمونه، حضور میکروارگانیسم های دیر رشد یا پرنیاز و مصرف آنتی بیوتیک وجود دارد.
&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>
&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;Background and purpose: &lt;/span&gt;Early and accurate diagnosis of bacterial meningitis is critical concern. Optimum and rapid laboratory facilities are not routinely available for detecting the etiologic agents of meningitis. The objective of this study was the comparison of polymerase chain reaction (PCR) assay with culture, for the detection of bacteria in CSF samples from patients suspected of meningitis in Hospitals of Qazvin.

&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;Materials and methods: &lt;/span&gt;100 CSF samples were obtained and divided in two parts. One part of samples was used for standard bacterial culture and gram staining. The remaining was used for DNA extraction. A PCR assay was performed with universal primers for 16S rDNA gene of bacteria. Performance characteristics of the test were determined.

&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;Results: &lt;/span&gt;The PCR method was able to detect bacteria in 36 cultures (..) positive and in 38 of 64 cultures were negative cases, showing sensitivity, Specificity of 100% and 40.6% respectively. Positive predictive value (PPV) was 48.6% and its negative predictive value (NPV) was 100%, however, Kappa coefficient showed the correlation of 2 methods to be at 0.33.

&lt;br&gt;&lt;span style=&quot;font-weight: bold&quot;&gt;Conclusion:&lt;/span&gt; There are advantages and disadvantages in performance characteristics of the conventional CSF culture and universal CSF 16S rDNA PCR. Therefore, it is recommended to use both methods in clinical practices, particularly in suspicious contaminated samples, with presumable presence of fastidious or slow growing bacteria and antibiotic consumption.
</abstract>
	<keyword_fa>مننژیت باکتریایی، 16S rDNA PCR، خصوصیات کارایی تست، قزوین</keyword_fa>
	<keyword>Bacterial meningitis, 16S rDNA PCR, performance characteristics, Qazvin</keyword>
	<start_page>14</start_page>
	<end_page>21</end_page>
	<web_url>http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-532&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>M.R</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sarokhani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ساروخانی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>sarokhani2002@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846005291</code>
	<orcid>10031947532846005291</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>P</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ayazi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>پرویز</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>ایازی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005292</code>
	<orcid>10031947532846005292</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>S.A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alizadeh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>صفرعلی</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>علی زاده </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005293</code>
	<orcid>10031947532846005293</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>F</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Foroughi</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>فرشاد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فروغی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005294</code>
	<orcid>10031947532846005294</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>A</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Sahmani</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>سهمانی </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005295</code>
	<orcid>10031947532846005295</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>M</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Adineh</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محترم</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>آدینه </last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>10031947532846005296</code>
	<orcid>10031947532846005296</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation></affiliation>
	<affiliation_fa></affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
