fa بررسی تنوع ژنتیکی مارکر rs6442530 در ناحیه ژنی COLQ به عنوان یک مارکر گویا در مطالعه مولکولی بیماری نشانگان میاستنی مادرزادی در جمعیت اصفهان پژوهشي-کامل Research(Original) <p dir="RTL">سابقه و هدف: نشانگان میاستنی مادرزادی <span dir="LTR">(Congenital Myastenic Syndrome, CMS)</span> یک بیماری ژنتیکی نادر با وراثت اتوزومـی مغلـوب می‌باشدکه در اثر جهش در ژن <em><span dir="LTR">COLQ</span></em> ایجاد می‌شود. تشخیص مولکولی این بیماری باآنالیز مستقیم جهش‌های ژنی بسـیار وقت‌گیر و پرهزینه می‌باشـد. از این رو روش پیوسـتگی با استفاده از نشانگرهای چند شـکلی تک نوکلئوتیدی <span dir="LTR">(Single nucleotide polymorphism, SNP)</span> برای تعیین افراد ناقل و هم‌چنین تشـخیص پیش از تولـد در خانواده‌هـای دارای فرزنـد مبتـلا روش مناسبی مـی‌باشد<span dir="LTR">.</span> هدف از این مطالعه بررسی آگاهی‌دهندگی مارکر تک نوکلئوتیدی <span dir="LTR">rs6442530</span> واقع در ژن <em><span dir="LTR">COLQ</span></em> می‌باشد.</p> <p dir="RTL">مواد و روش‌ها: در این مطالعه توصیفی- تجربی، ابتدا با بررسی بیوانفورماتیکی، نشانگر <span dir="LTR">rs6442530</span> واقع در اینترون شماره 1 ژن <em><span dir="LTR">COLQ</span></em> برای مطالعه ژنوتایپینگ در جمعیت ایران انتخاب شد. سپس 152 فرد سالم غیرخویشاوند از جمعیت اصفهان با استفاده از تکنیک <span dir="LTR">ARMS-PCR</span> تعیین ژنوتیپ شدند. فراوانـی آللـی، درجه هتروزیگوسـیتی و وجود تعـادل هاردی وینبرگ برای مارکر مورد مطالعه با استفاده از نرم‌افزار <span dir="LTR">Genepop</span> تخمین زده شد. درنهایت از نرم‌افـزار<br> <span dir="LTR">PIC Calculator</span> بـرای تخمیـن مقدار <span dir="LTR">PIC (Polymorphism Information Content)</span> اسـتفاده شـد<span dir="LTR">.</span></p> <p dir="RTL">یافته‌ها: نتایج حاصـل بیانگـر فراوانـی آلل مغلوب <span dir="LTR">(</span><span dir="LTR">Minor Allele Frequency, MAF)</span> 4/43 درصد، درجه هتروزیگوسـیتی 684211/48 درصد و مقدار <span dir="LTR">PIC</span> 3706/0 بـرای مارکـر <span dir="LTR">rs6442530</span> در جمعیـت اصفهـان بـود. بررسی تعادل هاردی وینبرگ نیز نشان داد که جمعیت اصفهان برای نشانگر <span dir="LTR">rs6442530</span> در تعادل می‌باشد<span dir="LTR">.</span></p> <p dir="RTL">استنتاج: در مجمـوع بـا توجه به نتایج به دسـت آمـده از مطالعه حاضر (2/0<span dir="LTR">MAF></span> و <span dir="LTR">PIC</span> نزدیک به 375/0) <span dir="LTR">rs6442530</span> می‌تواند به عنوان نشانگر مناسب جهت تشخیص مولکولی بیماری <span dir="LTR">CMS</span> در جمعیت اصفهان پیشنهاد گردد.</p> <p><strong>Background and purpose:</strong> Congenital Myasthenic Syndrome (CMS) is a rare genetic disease with autosomal recessive inheritance pattern which is caused by mutations in the <em>COLQ</em> gene<span dir="RTL">.</span> Molecular diagnosis of the disease using direct mutation analysis is expensive and time consuming. Alternatively, linkage analysis using Single Nucleotide Polymorphic markers (SNP) provides a suitable method in carrier detection and prenatal diagnosis of the disease in families with an affected individual<span dir="RTL">.</span> The aim of this study was to investigate the informative situation of rs6442530 marker in <em>COLQ</em> gene.</p> <p><strong>Materials and methods:</strong> In this experimental study, using bioinformatics investigations, rs6442530 marker located in intron 1 of <em>COLQ</em> gene was selected for genotyping studies. For this purpose, 152 healthy individuals from Isfahan population were genotyped using ARMS PCR technique. Then the allelic frequencies, the Hardy-Weinberg equilibrium and heterozygosity of the marker were estimated using the Genepop software. Finally the amount of Polymorphism Information Content (PIC) was computed by PIC Calculator software for the marker.</p> <p><strong>Results:</strong> The results indicated 43.4% Minor Allele Frequency (MAF), 48.684211% heterozygosity rate and 0.3706 PIC for rs6442530 marker in Isfahan population. Hardy Weinberg Equilibrium showed the presence of equilibrium for rs6442530 in this population.</p> <p><strong>Conclusion:</strong> Together, according to the results (MAF>0.2 and PIC close to 0.375) rs6442530 marker could be suggested as an appropriate marker for molecular diagnosis of CMS in Isfahan population.</p> نشانگر rs6442530 , بیماری نشانگان میاستنی مادرزادی (CMS), جمعیت, اصفهان, چندشـکلی های تک نوکلئوتیدی (SNP) rs6442530, Congenital Myasthenic Syndrome, Isfahan, population, Single Nucleotide Polymorphism 1 8 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-7282-34&slc_lang=fa&sid=1 Nafise Moeinifar نفیسه معینی فر No MSc in Genetics, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran کارشناسی ارشد ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران Sadeq Vallian Borujeni صادق ولیان بروجنی svallian@sci.ui.ac.ir Yes Professor, Department of Biology, Faculty of Science, University of Isfahan, Isfahan, Iran استاد، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران