fa تعیین ارزش تشخیصی روش آنالیز منحنی ذوب مبتنی بر Multiplex Real time برای شناسایی گونه های انتروکوکوس پژوهشي-کامل Research(Original) <p dir="RTL">سابقه و هدف:<em> انتروکوکوس</em>‌<em>ها </em>می‌توانند سبب آلوده شدن فرآورده ‌ای غذایی شوند. هدف از این پژوهش، جداسازی گونه‌های مختلف<em> انتروکوکوس</em> بر اساس روش <span dir="LTR">Curve Analyzing</span> <span dir="LTR">Melting</span> مبتنی بر <span dir="LTR">Real time PCR</span> در نمونه‌های مواد غذایی می‌باشد.</p> <p dir="RTL">مواد و روش‌ها: در این مطالعه تجربی، 138 نمونه مختلف (گوشت مرغ، گوشت قرمز، شیر، پنیر) آلوده به گونه‌های مختلف انتروکوک از مجموع 510 نمونه مورد بررسی از سطح شهر جمع‌آوری شد. شناسایی گونه‌های مختلف <em>انتروکوکوس</em> با هدف قرار دادن سایت‌های انحصاری در گونه‌های مختلف و طراحی پرایمرهای اختصاصی برای این نواحی بر اساس روش<span dir="LTR">Curve Analizing</span> <span dir="LTR">Melting</span> مبتنی بر <span dir="LTR">Real time PCR</span> صورت گرفت.</p> <p dir="RTL">یافته‌ها: بر اساس آنالیز منحنی‌های ذوب به روش <span dir="LTR">Real Time PCR</span>، 84 ایزوله (86/60 درصد) انتروکوکوس فکالیس، 48 ایزوله (78/34 درصد) انتروکوکوس فاسیوم، 1 ایزوله (7/0 درصد) انتروکوکوس گالیناروم، 4 ایزوله (8/2 درصد) انتروکوکوس آویوم و 1 ایزوله (7/0 درصد) به عنوان انتروکوکوس کاسلی فلاووس شناسایی شدند. بیش‌ترین فراوانی ایزوله‌های انتروکوک به دست آمده مربوط به نمونه‌های گوشت مرغ با 29 نمونه (63/24 درصد) و گوشت قرمز با 21 نمونه (44/51 درصد) بود. هم‌چنین با قرار دادن نتایج حاصل از تعیین توالی آزمون <span dir="LTR">PCR</span> به عنوان شاخص استاندارد، حساسیت و ویژگی روش فنوتیپی برای انتروکوکوس فکالیس به ترتیب 78/94 درصد و 74/90 درصد، برای انتروکوکوس فاسیوم 13/89 درصد و 77/97 درصد، برای انتروکوکوس گالیناروم 50 درصد و 52/98 درصد، برای انتروکوکوس آویوم 66/66 درصد و 52/98 درصد و برای انتروکوکوس کاسلی فلاووس 50 درصد و 56/98 درصد به دست آمد. ارتباط معنی‌داری بین نوع نمونه و پراکنش گونه‌های انتروکوکوس مشاهده شد (05/0<span dir="LTR">p&le;</span>).</p> <p dir="RTL">استنتاج: باتوجه به گستردگی و خطاپذیر بودن روشهای فنوتیپی در تعیین گونه<em> انتروکوکوس</em>‌<em>ها</em> ، و حسایت و ویژگی پایین این روش، استفاده از یک روش حساس و سریع الزامی است.</p> <p dir="RTL"></p> <p><strong>Background and purpose:</strong> <em>Enterococci </em>as a group of bacteria infecting raw foods and dairy products can contaminate different food products. The purpose of this study was to isolate strains of enterococci based on the Real time PCR method using melting curve analysis in food samples.</p> <p><strong>Materials and methods:</strong> In this experimental study, 510 samples were collected from which 138 different samples (chicken, meat, milk, and cheese) containing different strains of enterococci were investigated. Then, identification of <em>Enterococcus</em> species was performed by targeting specific sites and specific primers were designed according to Real time PCR-based melting curve analysis.</p> <p><strong>Results:</strong> Based on melting curve analysis by Real Time PCR, the <em>Enterococcus </em>species identified were as follows: <em>E.faecalis</em> in 84 isolates (60.86%), <em>E.faecium</em> in 48 ​​ (34.78%),<em> E.gallinarum</em> in 1 (0.7%), <em>E.avium</em> in 4 (2.8%), and <em>E.Caselli</em> <em>flavus</em> in 1 isolate (0.7%). The most frequent isolates were detected in 29 samples of chicken meat (51.44%) and red meat (n= 21, 24.63%). Considering the results of sequencing as a Gold a standard test, the sensitivity and specificity of phenotypic methods for <em>E.faecalis</em>, <em>E.faecium</em>, <em>E.gallinarum</em>, <em>E.avium</em>, and <em>E.Caselli</em> <em>flavus </em>were 94.78% and 90.74%, 89.13 % and 97.77 %, 50% and 98.52%, 66.66% and 98.52%, and 50% and 98.56%, respectively. A significant relationship was observed between the sample and distribution of <em>Enterococcus</em> species (P&le;0.05).</p> <p><strong>Conclusion:</strong> Due to extensive viability error in identification of <em>Enterococcus</em> species isolated from food by phenotypic methods, using a rapid and sensitive method is necessary.</p> <p></p> انتروکوکوس, Real-Time PCR , Curve Analyzing Melting Enterococcus, Real-Time PCR, melting curve analysis 234 247 http://jmums.mazums.ac.ir/browse.php?a_code=A-11-5029-424&slc_lang=fa&sid=1 Mohammad Reza Arabestani محمد رضا عربستانی No Associate Professor, Department of Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran دانشیار، گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران Hamed Tahmasebi حامد طهماسبی No MSc in Microbiology, School of Medicine, Zahedan University of Medical Sciences, Zahedan, Iran کارشناس ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی زاهدان، زاهدان، ایران Behroz Zeyni بهروز زینی b.zeyni.umsha@gmail.com Yes MSc Student in Microbiology, Faculty of Medicine, Hamadan University of Medical Sciences, Hamadan, Iran دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان، همدان، ایران