بررسی خوشه های پروتئینی در بیماری آتروفی عضلانی
با استفاده از آنالیز شبکه تعامل

رضایی طاویرانی, مصطفی; اخوتیان, فرشاد; زمانیان عضدی, مونا

دوره 29، شماره 173 - ( خرداد 1398 ) جلد 29 شماره 173 صفحات 10-1 | برگشت به فهرست نسخه ها

Mendeley

Zotero

RefWorks

Rezaei Tavirani M, Okhovatian F, Zamanian Azodi M. Evaluation of Protein Complexes in Muscular Atrophy Using Interaction Map Analysis. , J Mazandaran Univ Med Sci. 2019; 29 (173) :1-10
URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-11946-fa.html

رضایی طاویرانی مصطفی، اخوتیان فرشاد، زمانیان عضدی مونا. بررسی خوشه های پروتئینی در بیماری آتروفی عضلانی با استفاده از آنالیز شبکه تعامل . , مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران. 1398; 29 (173) :1-10

URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-11946-fa.html

بررسی خوشه های پروتئینی در بیماری آتروفی عضلانی با استفاده از آنالیز شبکه تعامل

مصطفی رضایی طاویرانی

، فرشاد اخوتیان

، مونا زمانیان عضدی^*

چکیده: (4801 مشاهده)

سابقه و هدف: یکی از بیماری‌های شایع ناشی از ابتلا به بسیاری از بیماری‌ها و کهولت سن، آتروفی عضلانی است. بررسی اتفاقات مولکولی موثر در ایجاد بیماری می‌تواند اطلاعات مفیدی در خصوص ارتقا روش‌های درمانی و حمایتی از بیماران فراهم نماید. این مطالعه با هدف بررسی تغییرات مولکولی در سطح ارتباطات پروتئینی با ترسیم و آنالیز شبکه تعامل پروتئینی بیماری اتروفی عضلانی، انجام پذیرفت.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه تجربی، با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و منبع STRINGشبکه برهم کنش پروتئین‌ها رسم و به کمک الگوریتم‌های وابسته به Cytoscape آنالیز شاخص‌های مرکزیت و خوشه‌های پروتئینی به کمک Network analyzer و MCODE انجام گردید. هستی‌شناسی کمپلکس‌های شبکه به کمک نرم‌افزار Bingo بررسی شد.
یافته‌ها: تعداد 5 پروتئین مرکزی شامل AKT1، ALB، DMD، SMN1و SMN2 در شبکه شناسایی، و 6 خوشه پروتئینی که 2 خوشه اول آن‌ها برای آنالیز هستی‌شناسی در نظر گرفته شد معرفی گردید.
استنتاج: کلیه پروتئین های مهم در این خوشه‌ها به صورت پراکنده وجود داشتند. به نظر می‌رسد که پانل بیومارکری معرفی شده شامل AKT1، ALB، DMD، SMN1و SMN2 می‌تواند در درک بهتر بیماری موثر باشد.

واژه‌های کلیدی: آتروفی، شبکه برهم کنش پروتئینی، خوشه های پروتئینی، بیوماکرها

متن کامل [PDF 399 kb] (2441 دریافت)

نوع مطالعه: پژوهشي-کامل | موضوع مقاله: بيولوژي

ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
	این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

Designed & Developed by : Yektaweb