ESR1 هدف جدیدی برای miR-15a-3p و lncRNA OIP5-AS1 و تحت تنظیم پلی مورفیسم rs2234693 در بیماران مبتلا به سرطان پستان: ادغام رویکرد بیوانفورماتیک و تجربی

میرزاییان, پردیس; شکرزاده, محمد; صالح زاده, علی; عجمیان, فرزام

دوره 33، شماره 230 - ( اسفند 1402 ) جلد 33 شماره 230 صفحات 69-50 | برگشت به فهرست نسخه ها

Mendeley

Zotero

RefWorks

Mirzaeyan P, Shokrzadeh M, Salehzadeh A, Ajamian F. ESR1 Could be a Novel Target of miR-15a-3p and lncRNA OIP5-AS1 in the Breast Cancer Patients, Regulating by rs2234693 Polymorphism: Integrated Bioinformatics and Experimental Approach. J Mazandaran Univ Med Sci 2024; 33 (230) :50-69
URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-20350-fa.html

میرزاییان پردیس، شکرزاده محمد، صالح زاده علی، عجمیان فرزام. ESR1 هدف جدیدی برای miR-15a-3p و lncRNA OIP5-AS1 و تحت تنظیم پلی مورفیسم rs2234693 در بیماران مبتلا به سرطان پستان: ادغام رویکرد بیوانفورماتیک و تجربی. مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران. 1402; 33 (230) :50-69

URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-20350-fa.html

ESR1 هدف جدیدی برای miR-15a-3p و lncRNA OIP5-AS1 و تحت تنظیم پلی مورفیسم rs2234693 در بیماران مبتلا به سرطان پستان: ادغام رویکرد بیوانفورماتیک و تجربی

پردیس میرزاییان

، محمد شکرزاده

، علی صالح زاده

، فرزام عجمیان

چکیده: (180 مشاهده)

سابقه و هدف: پس از بیماری‌های قلبی و تصادفات، سرطان به عنوان سومین عامل مرگ و میر در ایران و به عنوان یک مشکل عمده بهداشتی در بسیاری از کشورهای توسعه یافته و در حال توسعه در نظر گرفته می‌شود. در سرطان پستان، سلول‌های پستان بدون کنترل رشد می‌کنند. این بیماری بر اساس نوع سلول‌های پستان که سرطانی می‌شوند انواع مختلفی دارد. این سرطان حدود یک‌ سوم انواع سرطان را در جمعیت زنان تشکیل می‌دهد و علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان در سراسر جهان است. گیرنده استروژن-α یکی از ایزوفرم‌های گیرنده استروژن است که توسط ژن گیرنده استروژن (ESR1)کدگذاری می‌شود. ESR-α یک گیرنده هسته‌ای است که به عنوان یک فاکتور رونویسی وابسته به لیگاند عمل می‌کند. پس از اتصال استروژن، ESR-α به نواحی پاسخ استروژن در پروموتر ژن‌های هدف متصل شده وسبب تغییر در بیان ژن‌های هدف می‌شود. مطالعه حاضر به بررسی سطح بیان ژن گیرنده استروژن (ESR1) و RNAهای طولانی غیر کدکننده (lncRNAs) مرتبط با آن و بررسی فراوانی آلل و ژنوتیپ پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) rs2234693 در ژنESR1 در بیماران مبتلا به سرطان پستان پرداخت.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه موردی- شاهدی، بررسی بیان ESR1 و RNA های کدکننده و غیرکدکننده مربوط به آن توسط میکروآرایه (17 نمونه کنترل و 104 نمونه بیمار)،TCGA RNAseq (بر روی 113 نمونه نرمال، 1102 تومور اولیه و 7 نمونه تومور متاستاتیک) انجام شد. آنالیز داده‌ها توسط R Studio و limma و پایگاه داده‌های ENCORI و GEPIA2 صورت گرفت. ارزیابی تعامل microRNAها توسط miRWalk و یافتن برهمکنش lncRNA توسط lncBase 3 انجام شد. برهمکنش پروتئین- پروتئین توسط STRING و آنالیز بقا و همبستگی توسطGEPIA2 و ENCORI بررسی شدند. آنالیزهای غنی‌سازی مسیر و آنتولوژی ژنی (GO) توسطKEGG و Enrichr و بررسی SNP توسط آزمایش RFLP انجام شد.
یافته‌ها: بیان ژن ESR1 در سرطا پستان افزایش داشت و ژن miR-15a-3p تعامل قابل توجهی با ESR1 وlncRNA OIP5-AS1 داشت. OIP5-AS1 و ESR1 در نمونه‌های بیمار بیان مثبت معنی‌داری داشتند. فراوانی ژنوتیپ‌های TC، TT و CC در افراد سالم به ترتیب 65 ، 15 و 20 درصد و در گروه بیمار 38/5، 38/5 و 23 درصد بود. تفاوت معنی‌داری در شیوع ژنوتیپ‌های ژن ESR1 بین بیماران و کنترل وجود داشت.
استنتاج: پلی مورفیسم ESR1 ممکن است با افزایش خطر ابتلا به سرطان پستان مرتبط باشد و rs2234693 T>CSNP می‌تواند یک نشانگر قوی برای غربالگری سرطان پستان در نظر گرفته شود. OIP5-AS1 ممکن است پیشرفت سرطان پستان را با تغییر در تنظیم بیان ESR1 تنظیم کند.

واژه‌های کلیدی: پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی، سرطان پستان، ژن ESR1، RFLP-PCR، rs2234693، miRNA، شبکه ceRNA

متن کامل [PDF 2156 kb] (93 دریافت)

نوع مطالعه: پژوهشي-کامل | موضوع مقاله: سم شناسی

ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
	این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

Designed & Developed by : Yektaweb