سابقه و هدف: پروتئین اینترفرون بتا 1 بی، جهت درمان بهبود دهنده‏ بیماری MS و کاهش تعداد حملات در بیماران استفاده می‏گردد. روابط فیلوژنتیکی و آنالیز بیوانفورماتیکی پروتئین اینترفرون بتا 1 بی به صورت In Silico با هدف پیش‌بینی پتانسیل ساختاری‏اش توسط سرورها و ابزارهای بیوانفورماتیکی معتبر مورد پیش بینی قرار گرفت.

مواد و روش‌ها: ویژگی‏های فیزیولوژیکی و فیزیکوشیمیایی پروتئین اینترفرون بتا 1 بی نیز توسط سرور‏های ProtScale و ProtParam مورد بررسی قرار گرفت. ساختار سه بعدی پروتئین اینترفرون بتا 1 بی با استفاده از سرور
Swiss-Model و اثرات متقابل آن با پروتئین‏های دیگر توسط پلت فرم STRING بررسی شد.

یافته‌ها: نتایج تجزیه و تحلیل درخت تکاملی نشان دادند که پروتئین اینترفرون بتای انسانی بیشترین قرابت را از لحاظ ساختار اسیدآمینه ای به میزان 96 درصد به خفاش آبی دارد. نتایج بررسی In Silico ساختار پروتئین اینترفرون بتا 1 بی، حاکی از وجود توالی راهنما و عدم وجود منطقه تراغشایی در این پروتئین بود. نتایج پیش بینی تغییرات پس از ترجمه نشان دادند که در مناطقی از این پروتئین امکان استیلاسیون و فسفریلاسیون محتمل می‏باشد. نتایج تجزیه و تحلیل شبکه پروتئینی نشان داد که بیش‌ترین تقابل بین پروتئین اینترفرون بتا 1 بی و پروتئین گیرنده اینترفرون 1 و فاکتور تنظیمی 3 اینترفرون وجود دارد.

استنتاج: به طور کلی نتایج نشان دادند که پروتئین اینترفرون بتا 1 بی، پروتئینی با نقش تنظیمی موثر اما ناپایدار در شرایط آزمایشگاهی است. آنالیزهای بیوانفورماتیکی انجام شده روی پروتئین اینترفرون بتا 1 بی‌زمینه را برای مطالعات عملکردی آینده فراهم می‌کند.