کاندیدیازیس و آسپرژیلوزیس تهاجی به عنوان یک معضل بهداشتی منجر به عفونت‌هایی با مرگ و میر بالا در بیماران مستعد با ضعف سیستم ایمنی می‌شوند. مدیریت درمان موفقیت‌آمیز این بیماری‌ها، وابسته به شروع به موقع درمان، انتخاب داروی مؤثر ضد قارچی و شناسایی مقاومت‌های دارویی می‌باشد. با توجه به کاهش حساسیت طیف وسیعی از این پاتوژن‌ها به داروهای ضد قارچی در طول دهه‌های اخیر، شناسایی سریع موتاسیون‌های منجر به مقاومت دارویی در گونه‌های قارچی پاتوژن واجد اهمیت است. عمدتاً مطالعات صورت گرفته جهت شناسایی موتاسیون های منجر به مقاومت دارویی نیازمند روش‌های پیچیده و ابزارهای گران قیمت از جمله PCR و یا تعیین توالی می‌باشد. هرچند که امروزه استفاده از تکنیک‌های دقیق، سریع و با حساسیت بالا از جمله تکثیر دایره‌ای چرخان (RCA)، PCR-RFLP، Real-Time PCR و ARMS-PCR جهت ردیابی توالی هدف شامل پلی مورفیسم‌های نوکلئوتیدی را حتی در حد یک جفت باز فراهم می‌آورد. در مقاله مروری حاضر سعی شده که نحوه استفاده، مزایا و معایب این تکنیک‌ها در جهت شناسایی موتاسیون‌های احتمالی ایزوله‌های مقاوم به داروهای آزولی مورد بحث قرار گیرد.