دوره 32، شماره 214 - ( آبان 1401 )                   جلد 32 شماره 214 صفحات 166-153 | برگشت به فهرست نسخه ها

XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Hasanshahi Z, Dehghani B, Hashempour T, Moayedi J. Bioinformatics Study of the Interaction between Melittin Protein and P24 Protein in HIV and SIV Viruses. J Mazandaran Univ Med Sci 2022; 32 (214) :153-166
URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-14040-fa.html
حسن شاهی زهرا، دهقانی بهزاد، هاشم پور طیبه، مویدی جواد. بررسی بیوانفورماتیکی برهم کنش پروتئین ملیتین با پروتئین P24 ویروس‌های HIV و SIV. مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران 1401; 32 (214) :166-153

URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-14040-fa.html


چکیده:   (63 مشاهده)
 سابقه و هدف: P24 یکی از اجزای مهم کپسید رتروویروسها می‌باشد. مطالعات متعددی اثر مهاری پروتئین ملیتین را بر روی عملکرد ویروس ایدز نشان داده‌اند. هدف این مطالعه بررسی تأثیر این پروتئین بر روی پروتئین P24 در دو ویروس SIV (ویروس نقص ایمنی میمونی) و HIV (ویروس نقص ایمنی انسانی) با استفاده از نرم‌افزارهای بیوانفورماتیکی بود.
مواد و روشها: توالی‌های پروتئین P24 دو ویروس SIV و HIV از بانک ژنی دریافت شد و سپس توسط نرم‌افزارهای متعددی ویژگی‌های آن بررسی شد. هم‌چنین تشابهات ساختاری پروتئین P24 در SIV و HIV مورد مطالعه قرار گرفت و از آنالیز داکینیگ برای بررسی برهمکنش پروتئینهای ملیتین و P24 استفاده شد و پایداری نتایج داکینیک به روش دینامیک مولکولی تایید شدند.
یافتهها: وجود جایگاه‌های متعدد فسفوریلاسیون، گلیکوزیلاسیون و پیوند دی سولفید در پروتئین P24 مشاهده شد. نتایج داکینگ نشان‌دهنده‌ امکان اتصال بالایی بین پروتئین P24 هر دو ویروس و ملیتین بود. همچنین تشابه بالای ساختار سوم پروتئین P24 در دو ویروس مشخص شد. بررسی دینامیک مولکولی نشان دهنده پایداری مولکولی برهمکنش بین دو پروتئین ملیتین و P24 بود.
استنتاج: انرژی بالای اتصال بین ملیتین و پروتئین P24 نشان‌دهنده‌ امکان زیاد اتصال این دو پروتئین است که می‌تواند تعیین‌کننده اثر مهاری پروتئین ملیتین بر عملکرد ساختار کپسید هر دو ویروس باشد. بررسی تشابه ساختار سوم پروتئین P24 در هر دو ویروس نیز نشان داد علی‌رغم وجود تفاوت بالا در توالی پروتئینی، آن‌ها ازلحاظ فولدینگ و ساختار فضایی بسیار مشابه هستند. استفاده از ملیتین در مهار عفونتهای SIV در میمون‌ها می‌تواند به عنوان مدلی برای مهار ویروس HIV در انسان استفاده شود.
 
واژه‌های کلیدی: HIV، SIV، P24، ملیتین، بیوانفورماتیک
متن کامل [PDF 554 kb]   (36 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي-کامل | موضوع مقاله: ويروس شناسي پزشکي

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

ارسال پیام به نویسنده مسئول


بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2022 CC BY-NC 4.0 | Journal of Mazandaran University of Medical Sciences

Designed & Developed by : Yektaweb