Rajabi A, Emami A, Barzegarzadeh Namarvar B, Safaralizadeh R. Bioinformatics and Experimental Evaluation of UBE2W and SSX2IP Expression Levels in HepG2 Cancer
Cells Treated with Melatonin. J Mazandaran Univ Med Sci 2021; 30 (192) :12-23
URL:
http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-15237-fa.html
رجبی علی، امامی علی، برزگرزاده نمرور بهناز، صفرعلیزاده رضا. مطالعهی بیوانفورماتیکی و تجربی بیان ژنهای UBE2Wو SSX2IP در سلولهای سرطانی HepG2 تیمار شده با ملاتونین. مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران. 1399; 30 (192) :12-23
URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-15237-fa.html
چکیده: (2132 مشاهده)
سابقه و اهداف: هدف از مطالعه حاضر ارزیابی بیوانفورماتیکی و تجربی تاثیر ملاتونین بر بیان ژنهای UBE2W و SSX2IP در رده سلولی HepG2 تیمار شده با داروی ملاتونین میباشد. UBE2W پروتئینی را رمزگذاری می کند که باعث افزایش یوبیکویتینه شدن پروتئینهای گروه مکمل آنمی فانکونی شده و ممکن است در ترمیم آسیب DNA مهم باشد. SSX2IP متعلق به سیستم اتصال سلولی است که در حرکت سلول دخیل است و به عنوان یک عامل بلوغ سانتروزوم عمل می کند.
مواد و روشها: در ابتدا، نرم افزار MATLAB 2018a برای ارزیابی میزان بیان ژنهای UBE2W و SSX2IP از دادههای میکرو آرایه مورد استفاده قرار گرفت. سپس، بعد از طراحی و تهیه پرایمرها، آزمایشات تجربی شامل تست MTT و Real-time PCR انجام گرفت.
یافتهها: نتیجه تست MTT نشان داد که زنده مانی سلول مورد مطالعه در گروه تیمار شده با ملاتونین بصورت معنی داری کاهش می یابد و میزان IC50 برای 48 ساعت برابر 450 میکرومولار تخمین زده شد. نتایج Real-time PCR ثابت کرد که میزان بیان هر دو ژن مورد مطالعه در سلولهای تیمار شده با ملاتونین در مقایسه با گروه شاهد افزایش ( غیر معنیدار p≥ 0.05 در 24 ساعت و معنیدار p≤0.05 در 48 ساعت) می یابد که هم راستا با نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی میباشد.
استنتاج: نتایج این مطالعه نشان میدهد که UBE2W و SSX2IP میتوانند به عنوان ژن هدف در درمان هپاتوسلولار کارسینوما به کار گرفته شود، اگر چه برای تایید این نتایج نیاز به انجام مطالعات گسترده میباشد.
نوع مطالعه:
پژوهشي-کامل |
موضوع مقاله:
ژنتیک