معرفی یک متد تشخیصی برای شناسایی ژنوم ویروس 
SARS-CoV2 با استفاده از روش SYBR green Real-time PCR

مردمی, علیرضا; عابدیان کناری, سعید

دوره 31، شماره 206 - ( اسفند 1400 ) جلد 31 شماره 206 صفحات 159-154 | برگشت به فهرست نسخه ها

Mendeley

Zotero

RefWorks

Mardomi A, abediankenari S. Introducing a New SYBR green Real-time PCR for Detection of SARS-CoV2 Virus Genome. J Mazandaran Univ Med Sci 2022; 31 (206) :154-159
URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-17471-fa.html

مردمی علیرضا، عابدیان کناری سعید. معرفی یک متد تشخیصی برای شناسایی ژنوم ویروس SARS-CoV2 با استفاده از روش SYBR green Real-time PCR. مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران. 1400; 31 (206) :154-159

URL: http://jmums.mazums.ac.ir/article-1-17471-fa.html

معرفی یک متد تشخیصی برای شناسایی ژنوم ویروس SARS-CoV2 با استفاده از روش SYBR green Real-time PCR

علیرضا مردمی

، سعید عابدیان کناری

چکیده: (1578 مشاهده)

سابقه و هدف: روش‌های متفاوتی برای تشخیص مولکولی ژنوم ویروس کرونا معرفی شده است که روش های مبتنی بر تکثیر ژنوم از موثرترین تست‌ها برای تشخیص ویروس هستند. از آنجایی که اکثر کیت‌های تایید شده PCR برای تشخیص ویروس کرونا بر پایه TaqMan real time PCR هستند که به دلیل استفاده از پروب‌های حاوی فلئورسنت و کوئینچر هزینه تمام شده بالایی دارند. لذا، هدف از این مطالعه طراحی روشی ارزان و ساده برای تشخیص ژنوم ویروس کرونا براساس تست کمی PCR- SYBR green برای ژن نوکلئوکپسید ویروس بوده است.
مواد و روش‌ها: پرایمرهای اختصاصی برای ژن نوکلئوکپسید ویروس و نیز ژن کنترل انسانی به وسیله نرم‌افزار Oligo طراحی شد و از نظر اختصاصیت به‌وسیله قابلیت Primer-BLAST پایگاه NCBI مورد بررسی قرار گرفتند. نمونه‌های سواب بینی از 10 بیمار کرونایی تایید شده به‌وسیله PCR و نیز 10 فرد کنترل دریافت گردید و وارد مطالعه شدند.
یافته‌ها: واکنش‌های طراحی شده با انطباق کامل با کیت مورد تایید وزارت بهداشت عمل افتراق افراد سالم از افراد بیمار انجام گرفت به طوری که Cut-off برای Ct واکنش برای جفت پرایمر N1 برابر با 72/39 و برای جفت پرایمر N2، 69/39 محاسبه گردید.
استنتاج: واکنش طراحی شده براساس SYBR green real time PCR پتانسیل شناسایی ژنوم ویروس کرونا در نمونه های بالینی را از خود نشان داد و این روش در صورت طراحی مناسب پرایمرها و شرایط استاندارد واکنش می‌تواند به عنوان جایگزین کم هزینه‌تری برای روش TaqMan real time PCR مطرح گردد.

واژه‌های کلیدی: کرونا، واکنش زنجیره ای پلیمراز، پرایمر اختصاصی

متن کامل [PDF 1461 kb] (643 دریافت)

نوع مطالعه: گزارش کوتاه | موضوع مقاله: بیوتکنولوژی

ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
	این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی مازندران می باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

Designed & Developed by : Yektaweb