سابقه و هدف: راههای تشخیص باکتری E. coli، کشت، روشهای سرولوژی و ملکولی میباشد. در روش مولکولی با استفاده از پرایمرهای کوچک تصادفی، اقدام به تولید محصولات PCR میگردد. هدف از مطالعه حاضر، بررسی تنوع ژنتیکی در باکتریهای اشریشیاکلی میباشد. همچنین با استفاده از دو سویه شایع EnteroPathogenic E. coli (St.1) و EnteroHaemorrhagic E. coli (St.2)، میزان قرابت باکتریهای جداسازی شده با این دو سویه نیز مطالعه میگردد.
مواد و روشها: در مطالعهی تجربی حاضر 50 نمونه باکتری اشرسیاکلی جدا شده از نمونههای ادراری با آزمایشات بیوشیمیایی تعیین هویت مجدد شدند. سپس استخراج DNA با استفاده از کیت انجام شد و محصولات حاصل از PCR پس از الکتروفورز ارزیابی شدند. ماتریس یک/صفر باندها در Excel وارد و سپس با کمک برنامههای NTSYSPC2.02 و MVSP 3.2 مورد بررسی قرار گرفتند.
یافتهها: در مجموع از 8 پرایمر، 129 باند تولید شد. بیشترین تعداد باند تولیدی، مربوط به پرایمر 2 با 24 باند میباشد. 42 باند پلیمورف، 10 باند مشترک در تمام پرایمرها و 22 باند اختصاصی ویژه هر یک از پرایمرها به دست آمد. بزرگترین باند به اندازه Kb 3/7 مربوط به پرایمر یک و کوچکترین باند به اندازه Kp 80 مربوط به پرایمرهای 7 و 8 میباشد. براساس الگوی دندروگرام UPGMA و الگوی رستهبندی سه بعدی PCoA، ایزولههای 33، 47، 48 و 50 قرابت ژنتیکی نسبی با دو سویه استاندارد St.1 و St.2 از خود نشان دادند.
استنتاج: ایزولهها با ترسیم رستهبندی سه بعدی PCoA، تنوع ژنتیکی بالایی را از خود نشان دادند که بیانگر وجود تنوع مراکز آلودگی در انتشار باکتریهای مورد نظر میباشد. انگشت نگاری ایزولهها با این روش، قدرت تکرارپذیری بالایی را نشان داد و این میتواند درجه بالایی از اطمینان و صحت را در مورد این تکنیک نشان دهد.
بازنشر اطلاعات | |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |